作者：米粒儿
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上周文献精读开启了分科室教学，六个科室分别肿瘤，神经，消化，骨科，心血管，内分泌。在未来4周的时间，每周每个科室各更新一节视频课程。每周6节课程轮番轰炸，现在我们先来回复一下上周课程都讲了什么。
肿瘤
中文题目：CMTM6维持PD-L1表达并调节抗肿瘤免疫效应
主要内容：本文于2017年以letter形式发表在nature上，文章关注免疫检查点抑制这一研究热点。围绕PD-L1受到哪些分子的调控的问题，提出如下科学假设：
（1）CMTM6是PD-L1重要调节分子；
（2）CMTM6能防止PD-L1被核内体所降解。
为了证实该科学假设，作者首先采用CRISPR-Cas9筛选出本文主变量CMTM6，发现CMTM6和PD-L1呈现正向调控关系。接下来通过一系列实验证实CMTM6对PD-L1功能特异性，CMTM6是PD-L1内源回收的重要因子。最后论证CMTM6通过调节PD-L1水平来调节肿瘤特异性T细胞活性。
Mackaay老师将文章分为筛选-关联-机制-验证四部分，进行详细讲述，并以此为基础，对肿瘤免疫基础研究套路进行总结。除此之外，Mackaay老师还对如何运用CRISPR-Cas9技术筛选功能基因进行了细致描述。
神经
中文题目：病理学条件下，SNPH释放以不依赖于轴突线粒体自噬的方式去除线粒体压力
主要内容：选取文献发表在Neuron上，影响因子13.9。该期刊是Cell子刊，是神经科学领域的王牌期刊。本研究来自于NIH，Zu-Hang Sheng实验室，是轴突运输领域内有实力有传统的实验室。
本文主要关注轻度应激反应时期，回溯运输变化共提出一下3个科学假设：
（1）应激反应促进残缺线粒体在轴突中的清除；
（2）残缺线粒体会释放 SNPH， 促进线粒体在轴突中的回溯运输；
（3）在具有早期多发性硬化和阿尔兹海默病的神经元中，SNPH介导的应答作用会被特异激活。
为了证明该假设，作者进行了一系列离体和在体实验。本讲中彤同志老师为大家详细讲解实验过程，并分析轻度压力下，回溯运输研究套路。
消化
中文题目：消化链球菌通过影响胞内胆固醇合成促进结肠细胞增殖并导致小鼠发育异常
主要内容：本文发表在Gastroenterology上（IF2016=18.187），通讯作者是来自香港中文大学的于军教授。前人研究表明肠道菌群与结直肠癌（CRC）发生发展密切相关，作者前期通过16s测序和宏基因组学研究也发现厌氧消化链球菌在CRC中风度较高。
本研究在前期工作基础上进行分子机制探索，发现厌氧消化链球菌通过结合肠上皮细胞toll样受体TLR2/4诱导ROS产生进而促进胆固醇合成，也可能通过上调SREBP2表达影响胆固醇合成。蘑谷老师将文章分为表型，生信，机制和动物实验4个模块，就以上科学假设为大家细致剖析本文主要研究结果，并总结结直肠癌研究“疾型模法标”五恒量套路和文章主要脉络。
骨科
中文题目：类风湿关节炎相关的两个自身抗原与菌群免疫密切相关，并参与关节内的自身免疫反应
主要内容：本文发表在临床与基础结合较好的老牌医学杂志The Journal of Clinical Investigation（IF2016=12.784）上，文章作者是哈佛大学Allen Caruthers Steere教授。类风湿关节炎（RA）是一种病因未明的慢性、以炎性滑膜炎为主的系统性疾病。
在炎症等情况下，如果免疫耐受被打破，抗瓜氨酸化蛋白抗体（APCAs）将大量产生并最终导致RA。作者所在研究组前期发现普雷沃菌属与RA高度相关，且普雷沃菌属中的Pc-p27蛋白与RA高度相关。
本文中，作者又检测到两种新的靶向自身抗原GNS和FLNA与RA相关，并就这两个自身抗原与菌群免疫展开了一系列功能研究。芹菜将本文结果分为细胞体液免疫-分子模拟-临床相关-临床样本-遗传分析五个部分，深度解构数据、总结研究套路、并结合最新研究热点提出了多个可行性较高的研究策略。
心血管
中文题目：抗肌萎缩蛋白DGC通过作用于Yap抑制心血管增殖
主要内容：本文于2017年以letter形式发表在Nature上，关注成体心脏再生能力。前人研究表明，小鼠出生后7天内心脏有再生能力，表现为整体增殖、心外膜基因活化、血管新生等。而成年哺乳动物心脏受损后，缺乏重新长出失去的或者受损的心肌能力，由瘢痕体所替代。那么成体心脏如何获得再生能力？这是本文关注的主要问题。
作者通过构建DGC和Hippo通路双缺失小鼠模型证实二者同时缺失后，心肌损伤部位无瘢痕形成且损失部位心肌大量再生。以该现象为切入点，作者对Yap和DGC的作用模式进行了深入探讨。馒头老师将本文分为效应-通路-分子-序列四部分，由浅入深对文章主要结果进行剖析，并总结研究套路。
内分泌
中文题目：间隔饥饿法通过塑造肠道菌群调控白色脂肪米色化并降低肥胖
主要内容：本文选自代谢与内分泌领域权威的杂志Cell Metabolism（IF2016=18.163），是由湖南师范大学李国林博士研究组与美国国立卫生研究院癌症研究所Frank J. Gonzalez博士研究组合作完成。米色化脂肪组织是近些年新发现的一类脂肪状态，脂肪米色化可增加产热、降低储脂水平。
本文作者提出一种新的研究模型：间隔日饥饿法。在这个动物模型中，作者发现了一个脂肪细胞米色化，他推测并通过一些实验排除已有的证据发现了肠道菌群在其中发挥作用。进而就隔日饥饿法可通过改变肠道菌群诱导脂肪米色化这一科学假设展开了深入研究。本节课中，错错细致地讲解文章数据并提炼出研究套路。
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