蛋白互作网络、GO分析、基因与疾病、基因的蛋白在癌和癌旁的差异表达

1.如何查找一个基因在癌组织、正常组织中的蛋白质差异表达

进入UALCAN数据库（http://ualcan.path.uab.edu/）

网址：http://ualcan.path.uab.edu/

输入基因

点击【Explore】

点击总蛋白，然后玩手机，大半天之后，终于出来。

2.蛋白质相互作用（protein-proteininteraction，PPI）分析，PPI 网络。

STRING数据库:

https://cn.string-db.org/cgi/input

点击“Multiple proteins”，输入蛋白的基因名称，或者将所有蛋白名称整理到一个文件，直接上传文件即可。选择物种，点击search进入下一步。

网址：https://www.sohu.com/a/510624881_121077046

「青莲聚焦」蛋白相互作用研究神器——STRING

3.GO分析

方法一：Metascape网站

https://metascape.org/gp/index.html#/main/step1

方法二：DAVID官网：https://david.ncifcrf.gov/

https://david.ncifcrf.gov/

鼠标靠近Shortcut to DAVID Tools，选择Functional Annotation。

里面的数据，拿出来再用R语言分析。我去。

中文网站：http://www.bioinformatics.com.cn/

把按照网站要求，数据复制进去，图像太大的话，要调整这里才能看到。

然后气泡图就画出来了。

方法三：http://www.webgestalt.org/

进入东点一下，西搞一下。

方法四：GO分析（cytoscape）

方法：https://blog.csdn.net/d1234ghj/article/details/122877994

4.基因与疾病的关系

CTD数据库,全称Comparative Toxicogenomics Database,比较毒理基因组学数据库。

http://ctdbase.org/

CA10与肺部肿瘤的参考评分：11.42分。

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