文章题目：Gene expression microarray analysis reveals prognostic markers of survival inhigh grade astrocytomas
摘要：（Goole翻译）
目的：高级星形细胞瘤（HGA）是一种侵袭性脑肿瘤，总是相关的
预后差。在本文中，我们旨在探索HGA的遗传预后生物标志物。
方法：从26个获得的26个脑肿瘤样品的全基因组表达谱HGA患者从Gene Expression Omnibus下载。风险基因通过TCGA数据库中的数据对HGA的预后进行鉴定和验证。蛋白质 - 蛋白质建立了风险因子基因相互作用（PPI）网络，并建立了重要模块筛选。对风险基因和药物靶标进行功能和通路注释基因进一步分析。
结果：共有598个基因被确定为重要的预后危险基因，例如
关卡激酶1，钾内向整流通道，亚家族J，成员6，白细胞
受体酪氨酸激酶和未表征的LOC283887。所有HGA预后的风险基因
在细胞周期，有丝分裂以及有丝分裂后期均显着富集。而基因
在网络模块中主要参与细胞周期，有丝分裂细胞周期等功能
和细胞周期过程。此外，网络模块中的基因主要参与了网络
通路如细胞周期和细胞周期，有丝分裂。药物靶点分析显示七个
在Drugbank数据库中记录了基因，并且有多达32个药物记录
CHEK1。
结论：基于615低级胶质瘤和胶质母细胞瘤样品表达谱的数据验证CHEK1的预后效果。我们提出CHEK1作为预后HGA生物标志物。我们的工作可能为HGA治疗提供候选目标。
我们来看一下作者做了那些东西：
1、GEO的下载和矫正
2、根据高低表达画ROC曲线和生存曲线
3、PPI
4、GO 和 pathway富集分析
5、药物靶点分析
6、利用TCGA数据做Cox回归分析
通过以上分析，作者得出一个结论：CHEK1可以作为HGA预后的生物标志物。其实，我们完全可以拿到oncomine做一个验证，这样文章能发更高的分数。这次分享就到这里。
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