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环状RNA纯数据挖掘套路

第一步

在GEO数据库下载相关的环状RNA、miRNA、mRNA

第二步

分别对下载到的环状RNA、miRNA、mRNA做差异分析

第三步

利用差异的环状RNA预测可能结合的miRNA

第四步

预测得到的miRNA与差异miRNA取交集

第五步

将上面得到的miRNA预测靶基因

第六步

构建ceRNA网络

第七步

在TCGA数据库下载相关的miRNA数据和临床数据,与网络中miRNA取交集并且做相关性分析

第八步

对网络中的差异基因做功能分析,并且构建蛋白互作网络,提取hub基因并且做生存分析

现在只分享套路,后续我们将会提供范文和课程讲解。

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