参考文章题目:KIF4A enhanced cell proliferation and migration via Hipposignaling and predicted a poor prognosis in esophagealsquamous cell carcinoma
参考文章链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/1759-7714.13787
分析思路:
1、从GEO数据库中找到三套数据,然后分别使用GEO2R工具进行差异分析,下载得到的差异基因,分别取三套数据差异基因的交集
2、将上面得到的差异基因进行功能分析(GO富集分析、KEGG富集分析、PPI分析)及筛选hub基因
3、经过Oncomine、UALCAN数据库验证,发现KIF4A值得进行深入研究
4、通过Western blotting 和qRT-PCR进行验证,发现KIF4A也是高表达的(ESCC vs normal),然后进行相关生存分析
5、确定KIF4A在细胞系中的表达和转染效率
6、确定KIF4A促进ESCC细胞增殖
7、确定KIF4A增强ESCC细胞的迁移能力
8、确定KIF4A通过激活Hippo-YAP信号通路来促进ESCC细胞迁移和增殖
这篇文章做的实验还是挺多的,钱估计也花了不少,但是文章却发了2.61分的期刊,投入的科研经费与文章成果的出入有点大,比很多纯生信数据挖掘的文章要低分。不过也不出奇,之前也有粉丝朋友爆料说花了差不多一百万经费,最后就发了两篇2-3分的文章。可见,有钱也不一定能发高分文章,但是有钱发高分文章的机会更大,选择更多,很多没有钱的朋友只能做一下数据挖掘和meta分析。
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