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miRNA‑mRNA调控网络发文思路

参考文章题目:Identification of biomarkers and construction of a microRNA‑mRNA regulatory network for clear cell renal cell carcinoma using integrated bioinformatics analysis

分析思路:

1、在GEO数据库上搜索相关的miRNA和mRNA数据,然后下载整理进行差异分析

2、对差异的miRNA进行GO、KEGG富集分析

3、对差异基因进行PPI分析并筛选出重要的子网络,同时也对差异基因进行GO、KEGG富集分析

4、构建miRNA-mRNA网络

5、对网络中的差异基因进行生存分析

总结:

这篇文章发文思路比较简单,文章图片清晰整洁,作者仅仅分析了GEO数据库中的数据,并没有进行下一步的验证。其实,在这篇文章的基础还可以通过下载TCGA数据库的数据进行相关的验证,并且可以将网络中重要的miRNA或者基因构建模型计算risk score,然后将risk score结合临床因素进行分析

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