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蛋白质结构预测---蛋白质残基的基础知识(一)
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2023.04.07 中国台湾

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蛋白质结构预测---蛋白质残基的基础知识

  • 一、氨基酸的概念
  • 二、残基的概念
  • 三、蛋白质的概念
  • 四、小结

前言:本人人工智能专业出生,并非生物专业出生,主要利用人工智能技术解决生物信息领域问题,因此,需要涉及一些生物信息方面的基础知识,希望能帮助到你,如果错误,恳请指正!

一、氨基酸的概念

氨基酸是含有碱性氨基和酸性羧基的有机化合物,是组成蛋白质的重要小分子。一个氨基酸的结构通式如下图:

二、残基的概念

上文中说到氨基酸能够组成蛋白质。那么他们是怎么组成的呢?其实是通过一个重要的过程—脱水缩合,2个氨基酸脱水缩合的过程示意图如下:


残基(Residue):氨基酸之间的氨基和羧基脱水成键,氨基酸由于其部分基团参与了肽键的形成,剩余的结构部分则称氨基酸残基

为了方便理解,一个完整独立的氨基酸分子可以看成是一个完整的基,2个氨基酸分子脱水缩合后,每一个氨基酸都不再完整,所以可以看成是不完整的,即是残基。

人体中常见的20种氨基酸一栏如下图:

三、蛋白质的概念

蛋白质是生命的物质基础,是有机大分子,由氨基酸构成,是构成细胞的基本有机物,是生命活动的主要承担者。没有蛋白质就没有生命。

来一图片更直观的看一看蛋白质什么样子吧!就拿我研究的GPCR(一类特殊的蛋白质)来演示,他们在三维空间中大概是这个样子的:

四、小结

本节介绍了一些最基础的基本概念,我们需要知道:氨基酸—脱水缩合–>残基---->蛋白质。有这么一个概念就可以了。接下来会介绍具体介绍蛋白质方面的知识。
Ending~

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