gutMGene | 肠道微生物/微生物代谢物靶基因预测数据库

肠道菌群在最近的几年也开始成为了我们的研究热点。之前我们也介绍过一个关于肠道肠道菌群的数据库：[[gutMEGA-肠道微生物组学数据库]]。在这个数据库当中，我们可以查看某一个菌群在哪些疾病当中存在差异。我们在知道了某一个菌群有差异之后，如果要进行后续的实验设计还是需要知道这些菌群的具体作用机制。所以今天就给大家介绍一个用来预测肠道菌群靶基因的数据库：gutMGene: http://bio-annotation.cn/gutmgene/home.dhtml

背景数据集介绍

在 gutMGene 中，作者从近 400 份出版物中手动提取了==人类和小鼠==中的微生物-代谢物、微生物-靶标和代谢物-靶标关系。所有这些关系都在体内或体外通过实验验证，并通过 RT-qPCR、高效液相色谱、16S rRNA 序列等进行测量。

数据库使用

对于储存类的数据库，作者主要提供了两种功能以供用户使用。

1. 数据浏览

在浏览的的模块当中，我们在数据库的左侧点击想要查看的想要的内容即可。作者基于物种及具体的内容。分成了下面几个部分。

我们只需要想要查看什么内容就点击什么内容即可。比如想要查看和BCL2 有关信息。就寻找BCL2基因即可。结果是以表格的形式呈现的。

在结果当中，可以看到和 BCL2 有关的菌群，相关的代谢产物以及这个结果具体的参考文献。

2. 检索

如果我们有具体的目的的话，则可以在检索介绍直接进行检索即可。在检索界面也是分成了，物种以及具体内容的输入。

输入想要检索的内容，同样也可以得到👆 结果的表格。

总的来说

以上就是这个数据库的主要使用内容了。如果想要预测肠道菌群的靶点或者相关代谢物的可以在这个数据库当中检索一下。同时数据库提供了数据库检索的所有数据下载的功能。。。。。有兴趣可以去DIY。