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根际互作生物学实验室-2021-年终总结

写在前面

新的一年,可以平白无奇,但也给了大家一个阶段性重新开始的机会。愿我们学习做到极致,生活做到极致。祝我们所有为了更好明天的一切努力不被辜负。

随着2021年最后一天的过去,似乎新的时代悄然来临,从无声中窥思路,从嘈杂中拨方向,从热烈中炼力量,从质疑中走下去。今年不平凡,南京农业大学不平凡,南京农业大学资源与环境科学学院不平凡,沈其荣院士带领的我们土壤微生物与有机肥团队不平凡,因此,我们小组也将不平凡。

2021年注定了是不平凡的一年,疫情依然是这个社会最不稳定的的影响因素,我们几乎是在4月份才相聚到实验室,但是我们的力量早在新年开始就已经开始积蓄了。首先第一份恭喜谢鹏昊的第一篇文章顺利完成(4月份),再者恭喜洪文丹毕业快乐(6月份),其次恭喜本小组负责人袁军喜提江苏省优青资助(7月份),在此欢迎丁哲旭加入我们小组(7月份),文涛在八月份喜提老婆一枚(8月份)的同时完成微生物组大数据的姊妹篇,刘潇予在大量元素与土传病害的关系的课题上成功找到了大量元素介导下植物在时间梯度上对土传病害的响应。在九月份,欢迎新生力量张齐、张天翼、朱水英和贾南豫,与此同时赵新元和张天翼组合在木霉菌种子包衣工作中得到的突破性的进展,大半年的努力,牛国庆终于在多组学课题中得到了实质性的进展(11月份),杨盛蝶也完成了工作量十分浩大的进展性综述(11月份),王鹤棋,丁哲旭和谢鹏昊完成土壤和根际活性氧体系,随即开展相关工作。小组21年被接受的第一篇文章也诞生,发表于Fundamenal Research。21年底,同时恭喜牛国庆和丁哲旭完成雅思与托福考试,祝愿他们有一个好的结果。最最最最重要的还当属团队负责人沈其荣教授当选为中国工程院院士,从此团队有了长明的灯塔、英明的舵手和永不退役的领路人。

这一年,大家都在努力的工作,从年初,实验室就坐着两个人到现在实验室一大张坐满了7个人。大家在实验中逐渐更新的自己的设备,大的显示屏幕从之前的0,增长为5个。不知道大家敲坏了多少键盘,不知道用过了多少个实验记录本,样本的增长,只能再买冰箱存储。这一年,在袁老师的带领下,每个人的实验各自发力,组内两人合作项目,三人合作项目,多人合作项目有机结合,将奠定后续良好的科研生态。一个小组,一个生态,在沈老师和袁老师的带领下,逐渐走向成熟,力量逐渐强大,在我看来,这个小组换发这不一样的魅力,去年的这一切的工作,将在今天我们的欢声笑语中完美收官。

袁军(副教授)

文涛 (博士生)


总结:21年是不一样的一年,在过去的一年里,从学术上来讲,不仅完成了前几年工作的尾巴, 其次我设计了不同与以往的内容,研究方向进行了拓展。并且得到初步的结果 (FR接收)。虽然距离我上一年的目标尚有距离(21年的文章质量或者数量比2020年翻倍)。但是今年我确实在朝着这个方向努力了,在数量上翻倍是不可能的了,但是质量上我觉得还是有希望的。只是文章投稿并不是很顺利 (只能寄希望于21年上半年的稿件结果)。其次,在生活上,我与我的爱人也牵手走进婚姻的殿堂,并且在21年尾巴,我的宝贝女儿顺利降生。在21年,微生信生物的粉丝突破的2w人。
新年目标:希望在新的一年里,在袁老师的带领下,顺利毕业,顺利完成学生到工作的身份的交换。希望课题组的成果翻倍。22年上半年的文章说实话是21年写的,不能算是22年的工作,22年我目标写4篇文章(IF>10)。在生物信息工作上,希望继续深造,继续深造算法,完成至少一项有影响力的微生物相关原创算法。完成至少两项技术流程开发工作,并产生成果(专利,文章)两项。希望在媒体传播途径继续打开,为大家带来具有实质性意义和前瞻性的内容分享。

谢鹏昊 (博士生)

秋去冬来又一年,岁岁年年各不同。2021年感觉过的格外的迅速,一眨眼又到了年终总结的时刻。

这一年应该是最忙碌的一个阶段,每天都围绕着各种实验,遇到的最多的就是困难,自己也从刚开始的焦虑,到后来逐渐的学会如何去思考去解决,但是这个过程感觉自己还是损失了不少头发,也有了些许的白发。

虽然在科研能力上有些许的进步,但是以前的一些良好的生活习惯却没有很好的保留下来。像是早起锻炼,晚上按时歇息,如何平衡科研和生活应该好好思考一下,毕竟可持续发展才是永恒的主题。

新年目标:在新的一年里首先完善早期一个项目的实验结果,并在寒假完成文章的写作,争取早日投稿,后面可以有更好的条件去申请奖学金。分子实验上取得了初步的进展,也希望在回家前可以再构建好新的载体,这样开学后实验就可以迅速的开展。经过快两年的学习,分析上虽然有一些成果但是自己的创造性仍然有很大的欠缺,虽然可以对别人的代码进行理解以及改造,但是当自己有一个新的想法时很难自己造出来“轮子”,寒假应该对自己的代码写作的逻辑进行提高,这样也有助于后期的发展。同时今年也要加强锻炼,提高身体素质,这样也才能更好的应对实验以及各种挑战。

牛国庆 (助研

每年到这个时候都会感叹时间过得太快,是啊,就是在不经意的一瞬间从大家身边溜过,正如前段时间突然说的成语“白驹过隙”。
今年是收获的一年,五月份完成了自己的硕士毕业答辩, 成功取得了研究生学位证书,完成了一个小目标;今年是学习的一年,学习了从拿到数据做基础分析到从数据中找到差异点,如何去构建一条故事线;今年也是快乐的一年,来实验室也快有3年了,现在也是“高年级”学生了,在实验室有辛苦过,但快乐总是远大于辛苦,团聚咱们是真的可以;今年也是有点遗憾的一年,但是2021年的遗憾终究不属于2022年。2021再见,2022你好!
新年目标:希望成功上岸,顺利发表第一篇文章;同时祝愿我们课题组每个人生活上平平安安,快快乐乐,科研上乘风破浪,硕果累累。

杨盛蝶 (博士生)

时光飞逝,2021很快的过去了。回顾过去一年的研究生生活,虽然曾经历过茫然与彷徨,有过一些碌碌无为的日子,但总的来说还是充实、收获颇多的一年。科研上,这一年主要以学习分析、种苗、练习写作为主,不像第一年那么慌张迷惘,渐渐有了自己的节奏,稳扎稳打的继续研究课题,也取得了一些进展;此外,在数据分析、实验技能、英文写作方面得到了一定的提升,逐步积累了一些知识和经验。但是,这一年取得的结果还是远远不够的,一些事情被半途而废,没有坚持下去,只能徒劳无功。来年,需要花更多的功夫提升数据分析能力;统筹实验与分析,两者皆不可耽误;还需要多参加学术会议报告,多与同行交流,借鉴他人之长处;每件事情都能被画上句号。身体是革命的本钱,还是需要勤于锻炼,保证身体健康,才能更好地科研;此外,一直要以积极向上的心态去面对生活和科研。2022年,希望课题组越来越好,天天有数据,月月有文章;自己也能在各个方面都能够更进一 步,设立的小目标能够实现。新的一年,我要努力学习,潜心科研,拥抱美好的生活。

丁哲旭 (助研

过去的研究生学术经历更多的集中在某一特定领域内一株具备独特功能微生物的功能挖掘与分子生物学上的关于其特定基因的功能研究,所应用的技术也是小而微的精细活,另外在研究某些基因功能的同时,延伸到了ROS等更为特定的物质上;当然,做研究这个事情嘛,大小还是要均衡的,所以在生物材料上也了解和实践了许多关于x射线所衍生的诸多仪器与分析。现在,我也算是带着这些不是那么成熟的,甚至可以说只是皮毛的技术来到南农沈老师、袁老师的课题组求学,首先是见识到了在以前很多文章中关于生信的那些个分析是怎么做出来的,另外也接触到了土壤微生物与植物的互作这种对于我来说全新的课题。算算要学的东西还是很多的,希望也真的能扎扎实实的掌握相关的技术!以后呢,结合最近接触到的和以前我所研究的东西,也隐约有些思路或者火花星星点点的冒出来,但是总有种无法成文的感觉,这大概也是我想继续求学的目的与初衷吧当然,挣大钱也可以作为这段过程中的里程碑,要说有啥新年愿望呢,那可真是太多了,不过还是最希望稳定吧!

刘潇予 (硕士生)

竟然已经历经了一年的研究生时光,再回顾起来实在让人感慨。不过回头一看,自己还真是收获了不少,实验过程比以前更加熟练,设计时也会考虑的更完善,再看起来一些文章竟也能更快找到里面有帮助的信息了,还真正意义上的第一次分析了数据(也马上要自己分析代谢组啦耶!)。科研是个枯燥的过程,但绝不是无趣的,每一次小的进步都是对封闭真相润物细无声的揭秘。与实验室的师兄们和伙伴们一起进步摸索,回忆起来是欢乐也充实的,生活上经历了太多,细细碎碎的点缀起来,滴进情感的长河里,让人怀念又珍惜。希望2022年我们实验室都有大的进步和成果,希望大家都过的充盈,希望自己能积累更多的技能和知识,希望明年回顾的时候自己是个更加稳重和耐心的人。爸爸跟我说“你们做的事情,不管别人是怎么想的,但在我看来都是很伟大的事情,要谢谢你们。”诚然自然科学秘密是千丝万缕的复杂,红尘中的我们也不能真的完全免俗。但我总是相信,我们自己的每一份坚持,每一次都努力,无数科研工作者那些微小的进步们,最终都会融进时间里,成为每个人生命中光彩熠熠的战利品。

赵新元 (硕士生)

不经意间我们又到了岁末年终,对我来说2021年是我研究生生活中至关重要的一年,回顾这一年的工作历程,付出了努力也收获了成长,更值得庆幸的是在研究生期间收获了友谊。一年里,在老师和同学的关心帮助下,不断学习新的实验方法,无论是实验还是写作,与老师还有师兄交流后,思路、方法、熟练度都有一个很大的提升。有的时候,自己查阅再多文献,看再多的经验,可能也不如老师师兄的一句话的建议,这一年自己的实验也终于有了一定的结果,并且完成了木霉种子包衣的专利,自己的毕业课题也接近了尾声,最后的半学期主要是完成自己的毕业任务,写好论文找到未来的规划。在实验室的生活很开心也难忘,希望接下来的半年时间可以过的久一些,祝大家新的一年事事顺心, 科研顺利。

张天翼 (硕士生)

我的研究生生活其实开始得算早,2021年5月份就从哈尔滨飞到了南京提前半进入了实验室的生活, 主要是跟着师兄师姐做他们的实验的同时学习一些没掌握的基本的知识与技能,完整的参与了取土到收苗的温室栽培过程,没什么成果但总算第一次完整的体验了科研的过程,10月份的时候开始确定氧化物的杀菌浓度,期间出现了各种本可以避免的错误,好在这几天终于是走向正轨,实验结果也有了进展。以后的实验过程中一定要吸取这些教训,不能再犯低级的错误。下学期要正式加快提高我的实验效率,提前熟悉每一个流程,查阅大量相关文献,同时感觉在读研期间放在其他方面的精力很少 了,不像读本科时候一样广泛去探索自己的兴趣爱好,这样也有利于未来一年半的静心学习,尽快完成一个完整的研究课题。很感谢老师,师兄师姐,在这小一年间给我的帮助,同时也祝愿大家未来可以越来越好。

张齐 (硕士生)

来到实验室也将近接近半年的时间了,这学期主要做了就是筛菌的过程。最一开始的就是查找资料, 在文献中学习他们的试验方法。进入实验室后,首先做的,从乳酸菌饮料中筛选干酪乳杆菌,一开始的实验并不是十分顺利,从国产的酸奶中大多数含有的菌种的种类较多,而且菌的种类纯度不够。后来又尝试使用国外的养乐多,筛菌,过程也不算太美丽,一开始选的种类有干酪乳杆菌、副干酪乳杆菌和保加利亚杆菌。还有一些副成分的菌。最后结果,却只筛出来了干酪乳杆菌和一个鼠李糖乳杆 菌。幸好的是最后筛出来干酪乳杆菌了。后来又筛选了降解纤维素的菌了,纤维素的菌和前面的还有所不同,降解纤维素的菌需要做定性试验,需要用特别的水解圈看它的大小,整体来说结果还算可 以。最后筛出来了人参乳杆菌,嗜麦芽窄食单胞菌,乙酰微小杆菌,最近这两周刚测完这三株菌的酶活性。接下来的一段时间打算测各种酶活。这半学期也跟着师兄师姐们,也帮他们去种苗或者取苗,也大致了解了他们的实验,还学习了一些其他的实验等等。总得来说,这半学期的实验,往往是失败的次数还比较多,感觉有些细节的地方不够严谨。但是同样这半学期在实验室也学习了不少东西,熟悉了很多实验过程。希望自己再继续努力吧!

豫 (硕士生)

因为有事情的原因所以没能参与这次的提前的跨年还是有点可惜的。但总的来讲,虽然实验上有很多曲折的部分,但整体来讲也算是平稳得正式进入实验室,尝试自己搞实验了。希望下学期更顺利些。这学期在老师您和师兄师姐们的帮助下了解了更多实验安排和进行的细节,也马虎犯了不少错,浪费的材料也不少,希望之后能少犯些错。而我自己的实验部分,虽说是我的实验,但实验安排的细节上更多是师兄师姐们给的帮助,实验操作也是在同期们的帮助下完成的,很感谢。要说最大的经验教训,应该还是平时学习的时候要及时记录。跟着师姐做的时候没有记录的习惯,等自己正式做的时候再问也总是不详细,就会有很多的问题。所以还是要及时记录。还有就是实验方案,之前有写过实验方案,但没有坚持下来,实验方案变成了实验后总结,想想以后还是提前写好会更方便一些。还有就是,实验进行过程中,观察和分析是很重要的部分。这样即使是失败的,也算有些进度。之后就是读文献部分,读文献像在跟着指南走路。对我来说算是一片繁华秀丽陌生的风景区,我从一篇一篇文献顺藤摸瓜得找需要的知识点。虽然很囫囵吞枣,但整体感觉不错,好歹弄明白了自己在干什么。关于来年最希望的首先是我的苗能长好,然后才能开展接下去的工作。之后是打算了解一些根际互作以及别人的分泌物研究是怎么做的。还有就是看看分析方法,统计分析我还是不太明白。临时讲得有些乱,总之我的这学期是在老师和师兄师姐们以及同期们的帮助下度过的,很感谢各位,也希望新的一年实验室所有人都能事事顺利,开心健康。

朱水英 (硕士生)

不知不觉,我的研究生生活已经过去了六分之一,这半年,如果用一个物品来形容这半年的生活,我想应该是陀螺,总是不停地转,还是没有方向的转。从开学到期末,我依稀记得我种白菜时因为自己失误导致苗死了一个人在回宿舍的路上大哭的晚上。与同一届的同学们一起上课我才发现自己的知识储备是有多垃圾。而那些从未接触过的分子技术,那些基本上没学过的微生物,那些不知道从哪里下手的实验,好像都在说着:你不适合这里,你太差了!但是时间总会给人惊喜,对于我最恐惧的那些事情我好像也可以说一声:其实也没有那么难,慢慢来,学就好了。短短几个月的时间,从进入实验室毛手毛脚到现在看起来淡定自若的样子,从实验无法下手到现在可以独立设计实验,这些变化好像在告诉我,一切都在慢慢地往好的方向发展前进了。感谢我的老师,在我迷惑不解的时候给予指导,谢师兄师姐们,教会了我基本实验的操作,让我慢慢进步成长,感谢我的同学们,在平时实验上对我的无私援助。我不能保证自己一定会很优秀,但我一定会坚持走在变优秀的道路上,希望明年实验进展顺利,希望明年我可以拥有不一样的状态,不像这个学期一样迷迷糊糊。
新年目标:希望在新的一年里,能克服惰性,在生活上每天坚持锻炼身体,在学习上,提高文献的阅读积累量,增加自己的知识储备,坚持学习R语言。最后,希望实验进展顺利,课题进展顺利。

王鹤棋 (交流生

时间飞快,自从今年9月我进入A617开始做实验,不知不觉间已匆匆过半。在这段时间里,自己一直努力在向实验室师兄师姐学习,注重德、智、体各方面的积累和提高,取得了一些成功和进步,当然也经历了失败和挫折。总的来说,进步大于退步,收获多于失落,我又成长了许多。这一阶段在老师的指导下,各位同学的热情帮助下,我学到了很多,在思想上、学习上以及科研实践各个方面都取得了一定的进步。在实验上,师兄的带领下开展了活性氧的相关工作,得到了很好的进展。学会了高效液相色谱的使用等一系列仪器的使用方法,希望再2022年能有成果,并发表出来。

根际互作生物学研究室 简介

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