1．一块土地分期开发或多块土地同时分期开发，各期成本分摊比例是否正确
一个房地产项目共同的土地成本，是否按照当地税务机关的执行口径计算确定扣除金额；多个项目共同的土地成本，是否按照清算项目的占地面积占多个项目总占地面积的比例，或其他合理的方法计算清算项目的土地成本的扣除金额。
2．转让方式取得土地，开发商是否取得合法票据，转让方在转让过程中是否缴纳土地增值税。
3．计入土地成本的契税的计税基础与本次清算项目土地成本是否相符。
4．是否存在应计入期间费用的成本。
1．疑点：非本项目土地成本，不应扣除
案例7-6 丙房地产企业取得土地使用权的面积共计25,796.00㎡，其中普通商品住房用地19,832.50㎡，商业用地5,963.50㎡。企业土地增值税清算项目中房源均为普通住宅，企业全额列支了土地成本。
解析：与该房地产企业沟通核实，企业取得的地块后期无土地性质变更；通过规划总平图及三方数据中商业已在营业中等相关信息，确认本地块后期有商业房未在本次清算范围内。因此土地成本全部在本清算项目进行分摊不正确，应把商业部分占地面积进行剔除。
2．疑点：裙楼的土地成本没有合理分摊（以河北为例）
案例7-7 河北某房地产企业开发一栋商住综合楼(无地下)，总占地面积5000.00㎡（暂不考虑道路及绿化占地），土地成本4800.00万，建筑规模如下：1F-5F为商业，建筑面积22000.00㎡，A座、B座为6F-30F的公寓，公寓的建筑性质为住宅，建筑面积50000.00㎡，商业和公寓的销售比例均为100%，土地增值税清算时，土地成本应如何分摊？
解析：分两种情况予以考虑。
(1)公寓和商业是同一承重
(2)公寓和商业为非同一承重
由以上两种情况可知，建筑物是裙楼情况下，是否为同一承重对不同房源类型之间土地成本分摊不同，从而影响最终土地增值税清算的税负。
具体计算方法如下：
第一步：按独立占地的每栋建筑物占地面积占该项目占地总面积的比例计算分摊土地成本：
每栋可转让建筑物分摊的土地成本=每栋可转让建筑物占地面积÷可转让建筑面积占地总成本×土地总成本
第二步：对于同一建筑物中包含不同类型房地产的，应当首先确定该建筑物占地的总土地成本，然后根据该建筑物中某一类型房地产建筑面积占该建筑物总建筑面积的比例分摊土地成本：
普通住宅应分摊的土地成本=∑（每栋可转让建筑物普通住宅建筑面积÷每栋建筑物可售建筑面积×每栋建筑物应分摊的土地成本）
非普通住宅应分摊的土地成本=∑（每栋房地产非普通住宅建筑面积÷每栋房地产可售建筑面积×每栋房地产应分摊的土地成本）
其他类型项目应分摊的土地成本=∑（每栋房地产其他类型项目建筑面积÷每栋房地产可售建筑面积×每栋房地产应分摊的土地成本）
（1）疑点：购置土地环节支付的“招拍挂”佣金和购地环节支付的中介公司（个人）介绍费是否可以作为开发成本扣除？
解析：
《土地增值税暂行条例实施细则》（财法字〔1995〕第6号）第七条第（一）项“ 取得土地使用权所支付的金额，是指纳税人为取得土地使用权所支付的地价款和按国家统一规定交纳的有关费用”。
《海南省地方税务局关于印发土地增值税清算有关业务问答的通知》（琼地税函〔2015〕917号）第三条规定， '招拍挂'是政府出让土地的一种方式，对纳税人在土地出让环节支付的'招拍挂'佣金可视为'按国家统一规定交纳的有关费用'，作为'取得土地使用权所支付的金额'在土地增值税清算时据实扣除。在工程建设过程中发生的房屋测绘费、招标代理服务费，属于期间费用，在土地增值税清算时计入房地产开发费用。
3．应计入期间费用的成本
（1）疑点：购置土地环节支付的“招拍挂”佣金和购地环节支付的中介公司（个人）介绍费是否可以作为开发成本扣除？
《土地增值税暂行条例实施细则》（财法字〔1995〕第6号）第七条
《海南省地方税务局关于印发土地增值税清算有关业务问答的通知》（琼地税函〔2015〕917号）
（2）疑点：持有宗地期间缴纳的土地使用税是否可以计入开发成本？
解析：
《海南省地方税务局关于明确土地增值税若干政策问题的通知》
《青岛市地方税务局房地产开发项目〈土地增值税税款清算管理暂行办法〉的通知》
《大连市地方税务局关于进一步加强土地增值税清算工作的通知》
文章所分享案例思路，均来源于《数字税务——土地增值税清算数字化实践及案例》一书，想要获取更多详细案例及讲解具体可参考本书籍。
本书基于土地增值税清算这一难题，将我们对土地增值税清算工作的研究成果及多年的信息化实践经验相融合，阐述我们在土地增值税清算数字化践行之路的探索与发现，为我国现代化税收治理体系的建立、数据治理能力的提升、税收成本的降低提供一定的借鉴和参考。
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