多年来，一六六中学始终遵循“科研领先、效率为本、全面育人、整体提高、发展特长、办出特色”的办学指导思想，发扬“敬业乐群、求实进取”的校训精神，朝着“活而有序、优质特色”的方向，全面推进素质教育，教学严谨、扎实，严格管理、规范；教学改革、教科研活动活跃，基本实现了“学生满意、家长放心，社会好评”的奋斗目标。
学校深入开展三个主义（爱国主义、集体主义、社会主义）、三德（社会公德、职业道德、家庭美德）、三观（世界观、人生观、价值观）教育，以健全的制度抓住管理线，以良好的习惯抓住学习线，以真情的交流抓住学习线，以丰富的活动抓住兴趣线，以身边的榜样抓住激励线，以有效的形式抓住理想线。学校校风健康向上，学校先后获得北京市“综合治理先进单位”、“首都先进少年军校”、“法制教育先进集体”、“文明校园”、市教育科学“十五”规划重点研究课题“尊重教育”先进集体等荣誉称号。
学校秉承“以学生发展为本”的教育目标，自始至终狠抓提高教学质量这一永恒主题，牢牢把握提高课堂教学效率这一中心环节，积极开展教科研，多次举行市、区教育教学研讨会，学校连续多年被评为教科研先进集体，并成为“联合国提高中小学学习质量联合革新计划”实验学校。学校注重教育思想、教育观念的更新，推广使用现代化教学设备、教学手段，教学水平逐年提高，教学质量在区内名列前茅，高考升学率的比例几乎是年年百分之百，考入清华、北大等名校的比例在区内处于领先地位。1995年高考，学校有两名学生进入全市前十名；在1999年高考的10篇满分作文中，一六六中就占了3篇。同时为学有专长的优秀学生提供“高学术、深层次”的学习渠道，搭建科学家与学生之间“发现与被发现”的桥梁。学生有机会进入协和医科大学、北京大学、北京师范大学、北京理工大学、北京林业大学、中科院遗传所、生态研究中心、生物物理所、植物所、动物所、计算所等近20个科学实验室进行科研实践。
