2020年生信SCI文章数据年度回顾

一、生信SCI发文总量统计

小斯以关键词“gene expression omnibus”、“TCGA”、“bioinformatics”、“biomarker”、“differentially expressed”、“protein protein interaction”、“ROC analysis”、“signature”等进行组合，在Pubmed中检索了2020年相关见刊的生信分析SCI。

经过耐心+细心的筛选、去重复，最终检索到2020年发表的所有生信SCI共4165篇，其中纯生信（或仅含少量表达检测）文章3194篇，剩下的971篇生信实验类文章，其包含实验占比＞30%。影响因子IF>3有2552篇，IF>5有613篇，IF>7的有192篇。

二、期刊生信文章接收量排行榜

对2020年所有生信文章的发表期刊进行统计，将接收生信文章量大于30篇的期刊统计展示如下：

生信收录期刊大户	接收量	2020-IF因子
Front Oncol	181	4.85
Biomed Res Int	154	2.28
Front Genet	152	3.26
Aging (Albany NY)	129	4.83
Oncol Lett	101	2.31
PeerJ	93	2.38
Cancer Cell Int	87	4.18
Cancers (Basel)	84	6.13
Sci Rep	77	4
J Cancer	71	3.57
Biosci Rep	69	2.94
BMC Cancer	67	3.15
Med Sci Monit	65	1.92
Medicine (Baltimore)	62	1.55
Cancer Manag Res	61	2.89
Cancer Med	58	3.49
J Cell Mol Med	57	4.49
Ann Transl Med	51	3.3
PLoS One	44	2.74
J Cell Physiol	39	5.55
J Comput Biol	37	1.05
Mol Med Rep	36	2.1
J Cell Biochem	35	4.24
Int J Mol Sci	34	4.56
J Transl Med	34	4.12
Am J Transl Res	33	3.38
DNA Cell Biol	33	3.19
Technol Cancer Res Treat	33	2.07
Front Mol Biosci	30	4.19

从接收生信文章的期刊来看，Front Oncol、Biomed Res Int、Front Genet分别位居前三位，Front Oncol从去年的第二（104篇）飙到了今年的第一（181篇），进步很大。其次的Biomed Res Int、Front Genet分别为154篇，152篇。生信可以在以上期刊列表说是“亲生”的了，有需要投稿的生信文章，可以在上面挑一个投稿。

三、期刊生信文章影响因子排行榜

以接收量>20篇，影响因子>3筛选条件，期刊影响因子排序如下：

生信收录期刊大户	2020-IF因子	接收量
Theranostics	8.58	21
Cancers (Basel)	6.13	84
Bioinformatics	5.61	20
J Cell Physiol	5.55	39
Front Cell Dev Biol	5.2	23
Front Immunol	5.09	22
Front Oncol	4.85	181
Aging (Albany NY)	4.83	129
Int J Mol Sci	4.56	34
J Cell Mol Med	4.49	57
J Cell Biochem	4.24	35
Front Mol Biosci	4.19	30
Cancer Cell Int	4.18	87
J Transl Med	4.12	34
Sci Rep	4	77
J Cancer	3.57	71
Cancer Med	3.49	58
Cancer Biomark	3.44	26
Oncol Rep	3.42	27
Am J Transl Res	3.38	33
Ann Transl Med	3.3	51
Front Genet	3.26	152
DNA Cell Biol	3.19	33
BMC Cancer	3.15	67

按照影响力排序，TOP10期刊是Theranostics（8.58分）Cancers (Basel)（6.13分），Bioinformatics（5.61分），J Cell Physiol（5.55分），Front Cell Dev Biol（5.2分），Front Immunol（5.09分），Front Oncol（4.85分），Aging （4.83分），Int J Mol Sci（4.56分），J Cell Mol Med（4.49分）。可见2020年生信文章接收期刊影响因子最高的，并不是接收量最多的，恰恰相反是接收量仅为21篇的Theranostics（If=8.58），其次是Cancers (Basel)（IF=6.13，84篇），Bioinformatics（IF=5.61,20篇）。

四、单篇生信SCI文章影响力

2020年单篇生信文章影响力最高达到了IF=42.77，共有七篇文章达到这个水平，全部出自大名鼎鼎的Nature，泛癌研究。题目分别为：

• Microbiome analyses of blood and tissues suggest cancer diagnostic approach.

• Genomic basis for RNA alterations in cancer.

• The repertoire of mutational signatures in human cancer.

• Analyses of non-coding somatic drivers in 2,658 cancer whole genomes.

• The evolutionary history of 2,658 cancers.

• Patterns of somatic structural variation in human cancer genomes.

• Pan-cancer analysis of whole genomes.

最后，充满挑战和机遇的2020年已经过去，科研风暴在此致敬坚守岗位、奋战一线的广大医务人员！致敬博学笃行、砥志研思的科研工作者，致敬努力工作，热爱生活的小旋风们，祝新的一年里你的文章正如2021一样牛气轰轰~