复现Nature子刊图表：气泡图展示相互关系|

首先祝各位五一劳动节快乐呀！

今天做的是一副《nature microbiology》的气泡图，图比较简单，但是展示的内容可以是各种，我暂时想的是---（1）可以用这个气泡图展示两组变量的相关系数，相关性，气泡大小表示相关大小。（2）基因或者蛋白之间的互作，点的大小代表互作的强弱。（3）受配体关系的展示。可能还是有更多的用处，发挥自己的想象，总有用武之地。

文章图片如下：

（Reference：Core gut microbial communities are maintained by beneficial interactions and strain variability in fish）

就直接作图吧，比较简单，之前我们做过很多气泡图，这个也不是难事！

setwd("E:/生物信息学/互作点图")A <- read.csv("相互点图.csv", header = T,row.names = 1)library(forcats)A$B <- as.factor(A$B)A$B <- fct_inorder(A$B)
library(ggplot2)ggplot(A,aes(x=B,y= A,color=A)) +   geom_point(aes(size=Value)) +  scale_size(rang = c(0,10)) +  scale_x_discrete(position = "bottom" ,expand=c(0.2,0))+  labs(x=NULL,y=NULL)+  theme_bw()+  theme(axis.text.x=element_text(angle=90,hjust = 1,vjust=0.5),        panel.border = element_blank(),        axis.text =element_text(size = 12, color = "black"),        axis.ticks = element_blank())+  scale_colour_manual(name ="other", values =c('#efb306',                                               '#eb990c',                                               '#e8351e',                                               '#cd023d',                                               '#852f88',                                               '#4e54ac',                                               '#0f8096'))+  guides(color=F)

复现就结束了，还是可以！示例数据及注释代码会上传群文件！