生物学背景的Linux基础入门(1):虚拟机(视频教程)
大神不是天生的,天生的叫天才。天才我们穷及一生,也望尘莫及的,但每个人都具备成为大神的潜质,这完全取决于后天的努力和觉悟! ---KS科研分享与服务
Linux的基础入门教程总算是开始了,这也是我们2023年要完成的一个系列。我们不是计算机出身、也不是生信专业的人员,但都是从事组学分析,至少在研究阶段都要用到,也有兴趣涉猎。这个系列我们要做的还是领路的效果、启发的效果,让一个从未涉及过命令行操作的生物学背景的人至少会使用一些Linux。我们的目的还是会使用即可,例如一些转录组上游分析,一些需要涉及linux操作完成的事情。那么更深层级的涉猎需要自己入门后更加广阔的学习。
做这个系列的目的也是为了我们后续一些内容做铺垫,例如单细胞转录组、Bulk RNA-seq、ATAC等组学上游分析,还有RNA速率、MAGMA等等一些分析应用。
我们的内容也会有很多不足之处,对于初学者希望能有领进门的效果,大神们请轻喷,也希望多多提出一些指导意见,非常感谢!每个文字教程之后,我们都会出一期视频教程,以期达到更好的效果!1、电脑(最好是近几年的电脑,Windows11,太差太卡很难受)。2、一本书-《Linux命令行与Shell脚本编程大全》。关于计算机的构造什么的,网上有很多专业的帖子,这里我就不再多言,毕竟我也不是专业的。但是如何跨越学习计算机的鸿沟,以及要接受代码命令行操作,记住我的这句话:命令其实本质就是计算机语言,计算机语言不是让你去命令计算机,而是和它交流。和你学习英语一样,你要和计算机交流,就得学习它的语言!Linux其实就是一个操作系统,和Windows、苹果是一样的,只不过我们接触最多的是Windows或者苹果而已,所以才会觉得Linux离我们很遥远。电脑是一个载体,这个载体装了Windows就不能装别的系统了,Linux也是可以像Windows一样装在电脑上的,但是一个电脑只能容下一个系统,一山难容二虎。所以利用虚拟机,我们进入一个虚拟的系统去学Linux的操作。这里说一下为什么要用老掉牙的虚拟机,不直接用子系统、服务器:2、子系统没有桌面模式,难全面了解适应,且容易整坏自己本来的系统。3、虚拟机就是一个排除在外的、类似于独立的Linux系统电脑,可以装桌面版本的Linux,这样学习更有利于接受命令行操作。
4、虚拟机的Linux系统可以将模式调整为中文模式,更利于自己学习命令功能。Linux的发行版有很多,例如Ubuntu、Redhat、Centos等等。理解发行版,我举个不太恰当的例子,你就明白了。我们生活中熟悉的手机品牌有小米、Vivo、OPPO、魅族等等,他们牌子不一样,五花八门,但有一点是一样的,他们用的都是离不开的安卓系统。Ubuntu、Redhat、Centos就可以将其理解为Linux的牌子。那这里我们为什么用Ubuntu,因为我学的时候用的就是Ubuntu,所以其他的我就不想用了,就是这么任性。下面我们将就安装一个虚拟机和Ubuntu,开始Linux之旅吧!虚拟机我们使用VmWare(就是一个软件),为什么使用VmWare,还是那个原因,一开始学的时候就接触了它,就用它。虚拟机我下载的已上传QQ群,需要的自行下载。官网下载地址:
https://www.vmware.com/products/workstation-pro.htmlhttps://cn.ubuntu.com/downloadB站视频链接:https://www.bilibili.com/video/BV1Xk4y187HV/?spm_id_from=333.999.0.0&vd_source=05b5479545ba945a8f5d7b2e7160ea34)也可以关注我们B站的官方账号,后期有视频教程都会上传!
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