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Monocle2终极修改版
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2023.04.11 广东

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详情请联系作者:

虽然monocle3已经更新了,我们也出来帖子很久了,不论是基本分析还是个性化分析都有:
Monocle3(1):单细胞拟时分析---分析(详细注释版)
Monocle3(2):单细胞拟时分析可视化---普通版
Monocle3:单细胞拟时分析---个性化分析思路及可视化

但是很多小伙伴还是觉得monocle2好用,可能的原因是大家之前用的熟悉吧,或者monocle2分析结果更能对自己要求。但是我们知道找你monocle3自从出来后,monocle2就出现很多毛病,有些分析用不了了。我们也写过更新的帖子,还有网上有一些修改函数的方法,但是很遗憾有些小伙伴没整明白,有些错误。
群成员专享:Monocle2更新(就是重新梳理一下)

另外我们不放弃monocle2的原因是它可以做很多分析,以及结果的可视化和多角度解答。我们也写了一些个性化分析和好看的可视化。
一键跑完monocle2?
ggplot2个性可视化monocle2结果
ggplot修饰monocle2拟时热图:一众问题全部解决
单细胞拟时分析:基因及通路随拟时表达变化趋势

关于monocle2的修改在github有一个跟帖,前几天我突然收到一个互动邮件,说有一个修改更新后的monocle2的安装包。不仅解决了ordercell能正常运行,还解决了有些小伙伴即修改BEAM函数自然运行出错的问题。当即我就对这个包进行了安装测试,发现完全没有毛病。
也是第一时间分享给了微信vip群的小伙伴。

这我想是解决monocle2包运行会出错的终极解决办法了。如果你依然出错,我建议检查数据。理解monocle2的分析过程和参数!祝大家使用愉快!

压缩包已经下载上传到qq群文件了,可使用本地自行安装(这个应该都会吧)。安装前将自己之前的monocle2卸载吧。但是要注意,在使用monocle2的时候,不要加载你的momocle3,否则有些步骤运行会出错!
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