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pyscenic分析:视频教程
TS的美梦
>《待分类》
2023.08.09 广东
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详情请联系作者:
❞
我们之前更新过pyscenic的教程:
pySCENIC单细胞转录因子分析更新:数据库、软件更新
。我们也说过,我们号是放弃R语言版的SCENIC的分析了,因为它比较耗费计算资源和时间,所以我们的单细胞转录因子分析教程都是基于pyscenic的分析进行的。有
很多小伙伴反应,自己在实际操作过程中,总是报错,我猜测大多数是软件的问题。有些说想知道整个运行过程是怎么样的,所以我们出了这个视频教程,演示整个pyscenic的流程。当然,我们还介绍了docker镜像pyscenic分析。
单细胞转录因子的分析是需要利用服务器的:
KS推荐:生信分析服务器
。我们的这个视频
从数据准备、软件安装、步骤分析、镜像分析等等方面,展示了pyscenic分析的过程,最终得到分析结果。
不知道什么原因,
视频
这里上传不成功,所以可从B站链接观看:
https://www.bilibili.com/video/BV1Yj411r7dE/?spm_id_from=333.999.0.0&vd_source=05b5479545ba945a8f5d7b2e7160ea34
得到分析结果之后,那么后续的内容也就好办了,我们也写了很多的R语言版的分析和可视化,以及python版本的分析可视化。
PySCENIC(二):pyscenic单细胞转录组转录因子分析
PySCENIC(三):pyscenic单细胞转录因子分析可视化
PySCENIC(四):pyscenic结果之差异转录因子分析及其他可视化
pySCENIC单细胞转录因子分析更新:数据库、软件更新
pySCENIC单细胞转录因子分析更新(2):python版分析及可视化
pySCENIC可视化分析更新(3):python版可视化修改
视频制作不易,觉得分享有用的点个赞再走呗!
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