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科研 | Plant Cell:油菜素类固醇介导转录因子BES1抑制植物类黄酮生物合成、协调生长和紫外线胁迫响应(国人佳作)

编译:YQ,编辑:夏甘草、江舜尧。

原创微文,欢迎转发转载。

导读
紫外线B(UV-B)对植物的生长发育和适应性有重要影响,植物UVR8基因是UV-B光感受器,也是紫外线胁迫响应的重要位点。UV-B不影响UVR8的蛋白丰度,但诱导其在细胞核核聚集。光信号中心调控基因COP1可与UVR8互作介导UV-B信号,WD-40重复蛋白基因RUP1/2与UVR8互作诱导植物光形态建成和开花。此外UVR8还与BES1、MYC、WRKY、MYB转录因子发生互作,调控基因表达和植物光形态建成。UV-B可造成DNA损伤,触发活性氧积累,影响光合作用。而植物已进化出通过积累防晒类黄酮,包括黄酮醇、花青素和原花青素,限制UV-B损害。研究表明UVR8诱导MYB转录因子在UV-B下转录,调控下游查尔酮合成酶(CHS)表达,调控黄酮醇生物合成。
油菜素类固醇(BR)是一类植物发育所必需的甾体激素,涉及暗形态建成、光形态发生、热形态发生、细胞伸长增殖、开花。BR还参与生物和非生物胁迫反应,如干旱胁迫响应和免疫反应。受体激酶BRI1和BAK1感知BR信号,BRI1激活磷酸酶BSU1,触发糖原合成酶激酶BIN2的失活。BIN2的失活使得未磷酸化的转录因子BES1在细胞核中积累。
本研究表明BR负向影响植物对UV-B胁迫的耐受性。BR信号突变体改变UV-B胁迫耐受性,BES1作用于BRI1的下游抑制UV-B胁迫耐受性。BES1在BR介导下与MYB转录因子互作,抑制基因转录,从而抑制黄酮醇的生物合成和UV-B耐受性。UV-B胁迫通过抑制BES1的表达抑制植物生长,促进类黄酮积累。因此,BES1介导了植物生长和UV-B胁迫反应之间的平衡。

论文ID

原名:Brassinosteroid-Activated BRI1-EMS-SUPPRESSOR 1 Inhibits Flavonoid Biosynthesis and Coordinates Growth and UV-B Stress Responses in Plants

译名:油菜素类固醇介导转录因子BES1抑制植物类黄酮生物合成、协调生长和紫外线胁迫响应

期刊:Plant Cell

IF:9.618

发表时间:2020.08

通讯作者:刘宏涛

通讯作者单位:中国科学院分子植物科学卓越创新中心

DOI号:10.1105/tpc.20.00048

实验设计

① 植物材料。拟南芥野生型(Col-0),突变株(uvr8-6、myb11/myb12/myb111、BES1-RNAi、bes1-D、bri1、bin2),表达载体(Pro35S::BES1-Flag、bes、pBES1::LUC)。10d幼苗进行UV-B胁迫8h,进行表型分析。测定光系统II的最大量子产额(Fv/Fm)。

② 生化分析。HPLC测定黄酮醇含量,DPBA染色法对黄酮醇含量原位分析,UPLC-MS/MS分析内源BR含量。

③ 基因调控分析。在烟草上进行瞬时转录荧光素酶活性测定BES1启动子表达活性。染色质免疫沉淀检测BES1基因结合的DNA序列。电泳迁移率变动分析验证BES1蛋白与MYB11/12/111启动子的互作。

④ 转录组分析。对比bes1突变体与野生型在UV-B胁迫下的转录本,筛选差异表达基因进行GO富集。

结果

1、BR负调控UV-B胁迫耐受性

UV-B诱导的光形态建成有助于植物防御UV-B胁迫。BR可诱导UVR8调控抑制下胚轴生长,而BR信号是否调控植物对UV-B胁迫响应尚不清楚。由于UV-B损伤光系统II,本研究测量光系统II的最大量子产量(Fv/Fm)。结果表明,BR信号det2和cpd突变体比野生型拟南芥更耐受UV-B胁迫。同样地,BR受体突变体bri1-301和bri1-1比野生型更能耐受UV-B胁迫(图1A-B)。因此,BR负调控拟南芥的UV-B耐受性。
研究表明UVR8与BR信号通路的主转录因子BES1互作,抑制下胚轴伸长,本研究分析BES1是否参与调控UV-B胁迫耐受。BES1有5个同源基因,每个基因的单突变体都对UV-B胁迫的耐受性明显高于野生型。uvr8+BES1-RNAi突变株比uvr8突变体更耐受UV-B胁迫(图1A-B)。过表达株bes1-d对UV-B胁迫比野生型更敏感(图1C-D)。此外,bes1-D的过表达抑制了bri1-301突变株耐UV-B表型(图1E-F),表明BES1在BRI1的下游起调节UV-B防御反应的作用。
研究表明BIN2激酶磷酸化BES1并抑制其活性,本研究表明BIN2显性突变比野生型更耐受UV-B胁迫。研究表明BIM1与BES1共同调节UV-B胁迫的下胚轴伸长,而bim1、bim2、bim3三重突变体无明显的UV-B耐受性表型。因此,BES1是BR信号通路调控UV-B胁迫耐受的关键因子,而BIM1不参与这一过程。同时,BES1调控UV-B胁迫耐受的分子机制似乎与调控下胚轴伸长的分子机制有所不同。

图1 BR负调控UV-B胁迫耐受性。A-B:bes1突变株UV-B胁迫耐受性表型及PSII最大量子产额(Fv/Fm);C-D:bes1过表达株UV-B胁迫耐受性表型及PSII最大量子产额(Fv/Fm);E-F:bri1突变株UV-B胁迫耐受性表型及PSII最大量子产额(Fv/Fm)。

2、BES1抑制MYB转录因子表达,抑制黄酮醇生物合成

BES1是BR信号通路中的关键转录因子,调控许多基因的表达。被BES1上调的基因中,细胞壁生物合成相关基因显著富集(图2A),说明BES1促进植物生长。被BES1下调的基因中,类黄酮生物合成相关基因富集最显著(图2B)。这些类黄酮合成基因被BES1下调,但被UV-B显著诱导(图2C),包括黄酮醇合成酶1 (FLS1)、查尔酮合成酶(CHS)、黄酮3-羟化酶(F3H)、MYB12,说明UV-B和BES1拮抗调节类黄酮合成基因表达。

BR调节查尔酮合成酶和花青素合成,但BR是否调控黄酮醇生物合成尚不清楚。类黄酮的生物合成涉及多种酶和调控蛋白,PFG1/MYB12、PFG2/MYB11、PFG3/MYB111是激活黄酮醇生物合成基因表达的主调控因子。qPCR结果表明与野生型相比,这3个PFG/MYB基因在BES1-RNAi植株中表达上调(图2D)。因此,BES1抑制PFG/MYB转录因子的转录。

BES1抑制PFG/MYB基因转录表明BES1可能影响内源性黄酮醇水平。本研究用HPLC分析植物中黄酮醇含量。结果表明UV-B胁迫下BES1-RNAi、bri1-301和det2的黄酮醇含量高于野生型(图2E)。进一步采用DPBA染色原位分析黄酮醇含量。与HPLC结果一致,UV-B处理后uvr8中黄酮醇含量较低,BES1-RNAi和bri1-301中黄酮醇含量较高。因此,BES1下调PFG/MYB的表达,抑制黄酮醇的积累。

图2 BES1抑制PFG/MYB基因表达和黄酮醇生物合成。A-B:被BES1上调与下调的基因GO富集分析;C:UV-B胁迫下BES1调控的类黄酮相关基因表达;D:RT-qPCR分析野生型和BES1-RNAi突变体中PFG/MYB基因的表达;E:HPLC测定UV-B胁迫下幼苗黄酮醇水平。

3、BES1在BR诱导下直接与PFG/MYB启动子结合

研究表明BRRE元件(CGT GT/CG)和G-box元件(CACGTG)经常在BR抑制的靶基因启动子中富集。本研究发现PFG/MYBs启动子存在G-box和BRRE元件,G-box元件明显多于BRRE元件(图3B-D)。电泳迁移率变动分析表明BES1可与MYB11、MYB12和MYB111的启动子结合(图3A)。染色质免疫沉淀分析表明BES1与这些PFG/MYB启动子结合,而有些结合位点含有G-box,有些则没有。本研究还使用一种BES1抗体对来自野生型的免疫沉淀BES1-DNA复合物进行了共沉淀分析,证实BES1确实与PFG/MYB的启动子结合(图3E)。

根据传统BR信号通路,BES1对BR的响应是去磷酸化,去磷酸化后的BES1与生长相关基因结合,激活表达。与磷酸化的BES1相比,去磷酸化的BES1对PFG/MYB有更高的结合亲和力,BES1靶基因SAUR-AC(阳性对照)也得到类似结果(图3F)。因此,BR促进了BES1与PFG/MYB启动子结合。双荧光素酶(LUC)报告质粒表明,35S启动子驱动下,BES1基因高表达,而BES1显著抑制荧光信号,说明BES1抑制了PFG/MYB基因的转录(图3H-J)。因此,BES1以BR介导的方式直接与PFG/MYB启动子结合,从而抑制PFG/MYB的转录。

先前研究表明UVR8与BES1相互作用,抑制其与植物生长相关基因(如SAUR-AC)的结合,从而抑制表达和BR促进的下胚轴伸长,因此在这里探究UV-B对BES1与PFG/MYB启动子结合的影响。然而结果表明UV-B没有影响BES1对PFG/MYB启动子的结合活性(图3G)。因此,UV-B和UVR8并不影响BES1对PFG/MYB基因的DNA结合活性,UV-B可能通过其他机制影响BES1对PFG/MYB基因表达的调控。

由于BES1直接抑制PFG/MYB基因表达,抑制黄酮醇的生物合成,我们推测PFG/MYB作用于BES1下游调控UV-B胁迫响应。本研究将myb11、myb12、myb111三突变体(简称mybt)与BES1-RNAi或bri1-301杂交,得到BES1-RNAi+mybt和bri1+mybt突变株。与野生型相比,mybt的黄酮醇含量显著降低。BES1-RNAi的黄酮醇含量高于野生型,而BES1-RNAi+mybt的黄酮醇含量显著低于BES1-RNAi(图4A)。这些结果表明MYBs在BES1的下游起调控黄酮醇积累的作用。BES1-RNAi+mybt对UV-B胁迫敏感,抑制BES1-RNAi耐受UV-B的表型(图4B-C)。UV-B处理下bri1+mybt黄酮醇含量明显低于bri1-301,且bri1+mybt对UV-B胁迫敏感,说明bri1-301耐受UV-B的表型依赖于MYB。

图3 BES1在BR信号介导下与PFG/MYB基因启动子结合。A:电泳迁移率转移分析,两个箭头表示两个不同的BES1-MYB探针结合物;B-D:PFG/MYB的ChIP-qPCR启动子分析,红圈表示G-box元件,蓝圈表示BRRE元件,字母表示qPCR扩增片段;E:野生型和BES1-RNAi转基因株的ChIP-qPCR检测;F:BR处理促进BES1与MYB启动子的相互作用;G:UV-B处理不影响BES1与MYB启动子的相互作用;H:MYB启动子驱动的LUC报告质粒结构;I-J:BES1抑制MYB的表达。

图4 PFG/MYB作用于BES1的下游,调节UV-B胁迫耐受性。A:用DPBA对叶子的黄酮醇进行染色,荧光显微镜对其进行成像;B-C:BES1-RNAi+mybt突变株的表型分析及Fv/Fm测量。

4、BES1在UV-B胁迫时下调

UV-B处理对BES1与PFG MYB基因启动子的结合活性无显著影响。且UV-B胁迫对BR生物合成基因DWF4、CPD和BR6OX2表达影响不大,只是略有下降。通过测量UV-B处理后植株内源BR水平,包括油菜素甾酮(CS)、香蒲甾醇(TY)等,表明TY水平没有显著变化,而CS水平略有下降。

研究表明宽波段UV-B(280-315 nm)比窄波段UV-B(311-313 nm)更易引起应激。而窄波段UV-B对BES1转录和蛋白稳定性没有显著影响。本研究中,野生型和uvr8株中,UV-B处理使BES1蛋白水平下降(图5A)。虽然BR活化的去磷酸化BES1与PFG MYBs的结合亲和力比磷酸化的BES1高,但UV-B处理后磷酸化和去磷酸化的BES1水平均下降。RT-qPCR显示UV-B处理后BES1转录水平均下降(图5B)。因此,UV-B胁迫以一种不依赖uvr8的方式抑制BES1转录。在UV-B胁迫下,BES1、BEH1、BZR1转录水平下降,BEH2和BEH4转录水平没有变化,BEH3转录水平上升。因此,UV-B通过不同机制调控BES1及其同源基因。

为证明UV-B胁迫对BES1转录的影响,通过pBES1::LUC转基因植株,其中的荧光素酶基因(LUC)由BES1启动子驱动,分析植株中的LUC信号。结果表明宽UV-B显著降低LUC信号,而窄UV-B对LUC信号影响不大(图5C)。宽波段UV-B对BES1和BR诱导的BES1去磷酸化没有影响,说明UV-B胁迫主要抑制BES1转录,而不是蛋白稳定性和BES1磷酸化。

图5 BES1受UV-B胁迫下调。A:免疫印迹显示UV-B下BES1蛋白水平下降;B:RT-qPCR显示UV-B抑制BES1转录;C-E:低波长UV-B抑制BES1启动子激活。

讨论

1、BR激活BES1介导植物生长和UV-B胁迫耐受性之间的平衡

BR是一种重要的甾体激素,参与植物发育和各种应激反应。例如,在干旱胁迫下,BES1通过选择性自噬降解;BES1与干旱诱导的转录因子RD26相互拮抗;BES1和BZR1抑制脱落酸调控的转录因子基因的表达。先前研究表明UV-B信号通过抑制BR信号通路抑制植物生长。BR信号通路突变体bri和det2植株类黄酮含量高,抗UV-B胁迫能力增强。这些表型可能是由于BES1的双重功能,BR激活的BES1不仅促进生长,而且抑制PFG/MYB转录。此外,植物生长和体内黄酮类化合物积累之间存在平衡关系,过度积累的黄酮类化合物会抑制植物生长。BR信号通路促进BES1去磷酸化,促进其与PFG MYBs结合,表明BES1在UV-B胁迫耐受中的作用是由BRs调控的。虽然UV-B胁迫并不影响BR的含量和BES1的去磷酸化,但它通过一种未知的机制抑制BES1的转录。综上所述,BES1是调节植物生长和UV-B胁迫之间平衡的关键因素。

2、UV-B和BR对类黄酮生物合成具有重要作用

“防晒”类黄酮的积累,包括黄酮醇、花青素和原花青素(PAs)可保护植物细胞免受UV-B损害。HY5在MYB诱导中起关键作用。BES1对UV-B应激反应有直接和间接的影响。野生型与BES1-RNAi的PFG MYB表达无显著差异,而在UV-B处理下,BES1-RNAi株中PFG MYB的表达高于野生型。然而,无论是否UV-B处理,野生型和bes1过表达株的PFG MYB表达均无差异。野生型中可能已有足够的BES1蛋白抑制PFG MYB表达,因此BES1过表达的抑制并不显著。在BRZ(BR抑制剂)处理下,即使没有UV-B, bes1过表达株的PFG MYB表达也低于野生型,说明bes1对PFG MYB表达的影响是组成性的。

研究表明bri突变体在光照下生长时呈深绿色和矮化,BR突变体在UV-B调控的防御基因表达上存在缺陷,导致CHS(查尔酮合成酶)在bri1突变体中表达下调。而本研究与此结论不同的原因可能是实验中使用的植物年龄不同。本研究结果显示在5周龄幼苗中,无论是白光还是白光加UV-B条件下,bri1突变体中CHS和PFG MYB的表达均低于野生型。相比之下,在7日龄幼苗中,无论是UV-B处理还是未处理,bri1突变体中CHS和MYB12的表达均高于野生型。由此看来,发育阶段或年龄对BR调控类黄酮生物合成基因表达具有重要影响。综上所述,BES1控制生长相关基因和PFG MYB的表达,以介导植物生长和UV-B胁迫耐受性之间的平衡。窄波段UV-B光和BR介导UVR8-BES1相互作用使光和BR信号协调植物生长发育成为可能,而宽波段UV-B抑制BES1表达,诱导HY5表达,促进黄酮醇合成和UV-B胁迫耐受性(图6)。

图6 UVR8与非UVR8的UV-B响应调控模型。当植物生长无UV-B胁迫,BR信号通路激活BES1,抑制PFG MYB表达,调控类黄酮生物合成;当植物被窄波段UV-B照射时,诱导UVR8与COP1相互作用,促进HY5积累,从而启动UV-B光形态发生,包括激活PFG MYB的表达;当植物被宽波段UV-B照射时,除激活UVR8-COP1-HY5信号通路外,UV-B胁迫还以不依赖uvr8的方式抑制BES1的表达,类黄酮保护植物细胞免受UV-B胁迫。

评论

紫外线(UV-B)光是植物潜在胁迫因子,但植物如何协调生长和UV-B胁迫尚不清楚。本文报道了油菜素类固醇(BR)信号通过调控黄酮醇生物合成来抑制拟南芥和各种作物的UV-B胁迫响应,进一步证明了BES1介导植物生长和UV-B防御反应之间的平衡。BES1是参与BR信号转导的主转录因子,可抑制转录因子基因MYB11、MYB12和MYB111的表达,从而激活黄酮醇的生物合成。然而,宽波段UV-B会下调BES1的表达,从而促进黄酮醇的积累。这些结果表明,BR激活的BES1不仅能促进生长,还能抑制类黄酮的生物合成。UV-B胁迫抑制BES1的表达,使植物及时从生长转向UV-B胁迫响应。

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