黄药师姓黄，和一位知名人士有很大的关系。
不然的话，以他五绝的身手，为什么不要脸，非用一些下三滥的手段从周伯通那里抢一本经书？抢来之后不像欧阳峰一样去学习，而是束之高阁，最终徒弟偷走之后大发雷霆，将所有弟子打断腿之后，逐出桃花岛？
为什么他不顾夫妻之情，坐视身怀六甲的妻子冯蘅耗尽心血去背诵？是因为这本书与他有着密切的关系。
因为他的先祖就是黄裳，而《九阴真经》就是黄药师自己家的东西。
这事说起来得上溯到北宋末年徽宗年间，徽宗皇帝赵佶喜欢道教，自称道君皇帝，他于政和年间下诏，遍搜普天下道家书籍，进行雕版印行，一共有五千四百八十一卷，印好之后，皇帝圣心大悦，就起名为《万寿道藏》。而委派对这些书进行整理刻印的官员，就是黄裳。
黄裳是一个文官，他苦读诗书，于38岁才考上进士，高中三甲第一名状元。由于他生性好道，喜欢丹道之术，后来被委任刻书事宜。
这一年他已经五十岁，正在福州知府任上。还是这一年，萧峰、虚竹、段誉等人在雁门关外活捉耶律洪基，迫退辽军，萧峰用一支断箭结束了自己的生命。
但对黄裳来说，这些江湖事离他很远，在校对书籍的时候，害怕错了字而被皇帝责骂，治其罪，就很认真的，以治学的态度一字一句，认真揣摩，并请教道家高人进行校对。几年下来，于道家经典方面，黄裳已经成为天下少有的高手。
这个年龄难免有些腰酸背痛之事，于是黄裳就学习一些道家的吐纳之术，慢慢地悟出了一些武功中道理，无师自通，他内外兼修，成为一个武功高手。
宣和二年，南方方腊起义，他们的背景就是明教，明教又叫摩火教，自唐朝时传入我国，在南方很有市场，他们占据了江南大片土地。徽宗皇帝大怒，就让67岁高龄的黄裳带兵前往平叛。
明教自教主方腊之下都是一些高手，再加上失败后他们的下场会很凄惨，所以打起来将士用命，而禁军不过是领一份饷，在士气上远远不如，训练也不够，打了几仗，禁军都吃了败仗，一败涂地。
这怎么办？指望这些怂包，怕是自己的脑袋也保不住。黄裳书生意气，就修书一份，要与明教的几个高手比武，对方得知他只是一介文官，还是一个年过半百的老头子，就同意了他的要求。
但他们想不到的是，多年修道的黄裳，身轻体健，武艺高强，一口气打死了明教的好几个护法和光明使者，对方不服，广邀各派高手，来找回场子。他们骂黄裳不讲规矩，明明只是比武，大家点到为止，为什么你出手这么狠辣？
黄裳蒙了：你们忘了我是前来剿灭你们的朝廷命官吗？
又是一场大战，这些武林各派好手从没见过黄裳的武功（废话，自创的），结果又被杀了好几个人，由于对方人数太多，黄裳一看情况不对，就逃之夭夭。
哪知道他逃得了和尚逃不了庙。这些武林人士追不上黄裳，就派人到福建延平将他的家人，一家四十多口人给屠了个干干净净，连妇孺都不放过。当黄裳甩脱了追兵，回到家里，再看满目残骸的时候崩溃了，一个老头子无力地坐在地上，看着自己的亲人，自己的几个儿子，儿媳，孙子都死不瞑目，哭得死去活来：
魔教妖孽，我黄裳不报此仇，誓不为人！（从黄裳开始，魔教成为明教的代称）
他知道自己不是这些人的对手（没办法，对方人太多，真有几个高手），就找了一座深山，在里面建了一座草庐开始闭关，他能考上状元，自有过目不忘之能，凭着这个特长，他将那十几个敌手的武功招式，一招一式全记在心里，苦思破解之术。就这样，山中不知岁月，一眨眼几十年过去了。
当黄裳出山找他们复仇的时候，才发现这些敌人一个个都不见了，后来他终于找到了一个仇人，此人是灵宿派穆女侠，当年只是一个十六七岁的女孩，号称江湖第一美人，而如今已经五十多岁，成为一位鸡皮鹤发的老太太。原来黄裳在山里这么一待，竟待了近三十多年。
这个曾经的江湖第一美人，当年被他伤了肺经，如今躺在床上，形销骨立，那喘气像拉风箱一样，怕是不用他动手，没过几天也会死去。这一下他心里淤积了几十年的仇恨，一下子消失了。他哈哈大笑，笑声中充满苍凉和无奈。
老夫已经活了九十多岁了，又有几年可活？但我的心血不能白费，要保留下来，传于后世。
于是他将毕生所学著成了一本书，由于他讲究以柔克刚，以阴治阳，所以这本书起名字叫《九阴真经》，他将经书用油布包了，放在了福建延平老家的一个祠堂里。
三十年后，一个少年在这里玩耍，无意中发现了这本经书，《九阴真经》才得以传于后世。
再说黄家，黄裳以为自己一家人都被杀，整个黄家绝后了，其实不然。
他有一个儿子黄靖，不喜习文，反而对拳脚功夫特别的喜欢，就四处拜访名山，寻找一些武林大派进行学武。
有一天他在天山遇到了一个须发皆白的老头子，此人自称虚竹子，非僧非道，一个人在摆一个残局。黄靖家学渊源，对博弈之道颇有心得，和对方下棋，百十回合之后，胜了对方。
虚竹子哈哈大道：我当年因为珍珑棋局，遇到了师父无崖子，当时是误打误撞，又有人暗中相助，才破了局。想不到你竟一个人破局，甚是了得。
黄靖暗想：不就是珍珑棋局吗？我家藏的棋谱中有破解之道。这算什么呢？
虚竹子问黄靖，你可曾愿随我学武？
这正遂黄靖的想法，他连忙下跪，向虚竹子磕头。原来这个虚竹子就是当年的虚竹，天龙三兄弟之一。他本是灵鹫宫主人，后来娶了西夏公主李清露为妻，他们二人过了十年的夫妻生活，但李清露随着年龄的增加，变得强势多疑。她把控了灵鹫宫，将原来的老人都赶了出去。
当虚竹子发现不对的时候，整个灵鹫宫已经不是当年的灵鹫宫，仿佛另外一个西夏王庭。元丰五年，宋军围攻西夏永乐川，逼近国都兴庆府，李清露率领由她控制的灵鹫宫重组西夏一品堂，到阵前效力，结果被中原武林人士击败，李清露伤重而亡。
虚竹将她的遗体抢了回来，葬在天山之上，但望着空荡荡的灵鹫宫，他也不愿在里面多呆，就下山云游四方。十年后，他回到天山凭吊天山童姥及李清露，结果在山下遇到了黄靖。
黄靖跟着虚竹学了许多武功，比如说天山折梅手、天山六阳掌、小无相功，除此之外，灵鹫宫里的各种武学典籍，甚至星相占卜之术，黄靖都有涉猎。
后来，黄靖学成下山，却发现自己家被灭门，父亲也不知所踪，他以为父亲也死在仇敌之手，就离开了延平，将黄家迁到了浙江，在那里他娶妻生子过得其乐融融。
后来北宋灭亡，大宋子民在金兵铁蹄下呻吟，黄靖不愿百姓受苦，就北上寻找康王赵构，后来成为南宋朝廷的一名官员。绍兴和议时，黄靖乃主战派，一直呼吁北上收复故土，还我河山。，和当时的岳飞岳王爷相交莫逆。
只可惜赵构此时已经失去了斗志，他畏金军如虎，贪图享受这临安的山外青山楼外楼，西湖歌舞，就听从了秦桧的主意，决定以岳飞一人之性命，换宋金百年之和平。任由秦桧在风波亭上杀害了岳飞。
当时黄靖正在联络百官上万民书，保岳飞性命。消息传来，黄靖吐血三斗：奸贼秦桧误我百姓，当不得人子！
他一边哭一边破口大骂，哪知道第二天，秦桧就下令将黄家抄家，发往云南充军。黄靖不服，前往秦王府行刺，被秦桧网罗的武林高手围攻，最终力竭而亡，砍为肉泥。
你以为秦桧逃过一劫了吗？
绍兴二十五年，秦府。当秦桧正倚案读书之时，发现屋子里多了一个人。这个人非僧非道，须发苍苍，他堵住秦桧的口，用生死符将其折磨得欲仙欲死，筋疲力尽之时，才用“七色七花之毒”将秦桧毒死。
秦桧已死，他的余党如丧考妣，王氏哭得死去活来。但为了掩人耳目，就对外号称秦相为国效力，鞠躬尽瘁，得了重病而逝。
听闻秦桧死去，皇宫里，一个身着黄袍的中年男子哈哈大笑，笑过之后又涕泪横流：秦贼已死，朕再也不用在上朝时，靴里藏匕首了。
再说黄靖，他有一子一孙，都被发配到云南，孙子在丽江出生，由于他非常佩服唐初的军神李靖，李靖字药师，这个孙子就给自己起名为黄药师（想起名黄靖，但他爷爷叫黄靖，只能避讳）。
黄家家学渊源，脑子很聪明，学什么东西都特别快，学文，不到十岁就可以做出一篇锦绣文章，学武，不到二十岁，已经打遍整个大理无敌手。
他学得挺杂，星相占卜，连种树的书籍，他都喜欢看。只是性格比较燥，像一个愤青，他不满南宋朝廷的举动，就处处大骂。偏偏骂得还很有理。他老爹对他也无可奈何。
有一次，他竟骂当朝皇帝无耻，老年昏庸，活该无子。被老爹一顿棍棒伺候之后，赶出了黄家。
于是黄药师就来到了海外的一座荒岛之下，在这里他遍植桃花，建有奇形八阵，这才有了后来的桃花岛。在这里，他结合爷爷传授他的武功，自行修炼，后来成为一代宗师。
直到有一天，他听闻老家福建延平祖宅里被人发现了一本《九阴真经》的书，他想起了自己的先祖黄裳，就发誓一定得到这本书。
他前往延平，格杀了好几派高手，却听闻经书被一长须道人抢走，而这个人就是王重阳。
他顺着此人留下的踪迹一直从福建追到江南，又从江南追到了北方金国境内，最终临南山下，对方停住了脚步。
而和他一起追过来，对经书不离不弃的，还有几个人，一个是大理段氏之后，身形华贵；一个是来自西域白驼山，复姓欧阳；还有一个叫化子，乃丐帮的八袋长老，姓洪名七。
看着这几个人穷追不舍，长须老道停住 了：
诸位兄台都对这本《九阴真经》势在必得，但几个月的较量，怕是一时也分不了胜负。要不老道作东，华山之上，我们一决胜负，以定《九经真经》的归属，怎么样？
（全剧终）
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