晋愍帝被刘聪所杀。
司马睿听说晋愍帝的死讯后，被推举即位，就是晋元帝。
晋元帝要奖赏此次建议其即位的官员和百姓，一共有二十多万人。有人因此劝谏，晋元帝不听。
石勒自称赵王，史称后赵。石勒用法严厉，而且十分忌讳“胡”字。
司马保自称晋王。后被其手下所杀。
刘聪去世，刘粲即位。
靳准作乱，杀死刘粲，并将刘氏大部杀死，自称汉天王。
刘曜、石勒起兵讨伐靳准，刘曜即位。
刘曜部将与巴蜀部落谋反，刘曜杀死部将。游子远劝谏刘曜不要多杀，被刘曜囚禁起来。巴蜀部落因此反叛，游子远在狱中再次劝谏，刘曜大怒，要杀了游子远，经众人劝阻之后，游子远被释放。
刘曜要亲征巴蜀，游子远又来劝谏说，您如果听我的，给我五千士兵，一个月就能平定叛乱，您也不用亲征。刘曜同意。
游子远所到之处，叛人尽皆归降，剩有十多万人不降，抵御游子远，五战皆败，接着又带兵五万前来进攻游子远。游子远坚守不出，乘夜出兵袭击，大胜敌兵。于是叛人全部投降。
祖逖与后赵对垒。祖逖命令士兵用粮袋装土引诱敌兵，暗藏一些粮食。敌兵前来争夺，祖逖故意丢下粮食撤退。敌兵以为祖逖粮食充足，十分畏惧。祖逖又截获了敌兵运来的粮食，敌兵只好撤退。很多后赵士兵前来归附祖逖，后赵守卫边境的士兵越来越少。
祖逖善施恩德，后赵人常常把机密偷偷告诉祖逖。
最后，黄河以南的地区，大多脱离后赵，归附于晋。
石勒见势不好，就去为祖逖修祖坟，又给祖逖写信，请求互通使节和贸易。祖逖不答复，默认双方的贸易，获利十倍。
祖逖这边有叛离到后赵的，石勒都将其杀死，通报祖逖。祖逖因此也不接纳后赵的叛离者，并告诫部下不侵扰后赵的百姓。由此双方的边境暂时得到缓和。
周访去世，其在世时深得人心。周访知道王敦有叛逆之心，对王敦十分痛恨。有周访在，王敦也始终没敢作乱。
早期，王敦与王导尽心辅佐晋元帝，后来王敦自恃有功，王氏家族势力强盛，王敦开始膨胀，晋元帝对其开始畏惧和厌恶，于是逐渐削弱王家的权力，晋元帝与王敦的矛盾逐渐加深。
王敦上书，表示出不满，王导把奏疏退了回来，王敦却重新递了上去。晋元帝把王敦的奏疏给司马氶看，司马氶劝晋元帝早做决定。
晋元帝派司马氶去湘州，王敦对司马氶说，你恐怕无法胜任吧。司马氶说，您有所不知，铅刀也能割东西啊。王敦仍认为司马氶不堪大用，听凭他去了。
晋元帝以战备名义，派人驻扎四方，以此防备王敦。
祖逖见朝廷情况，知道会有一番内乱，自己壮志难酬，忧郁而死。王敦听说祖逖死讯，更加肆无忌惮。
不久，王敦以讨伐刘隗为名起兵，派人去请司马氶。司马氶拒绝，发檄文征兵反击王敦。
晋元帝让刘隗回京，百官在路上迎接。刘隗自以为得势，趾高气扬。入宫后，刘隗劝晋元帝把王氏家族全部诛杀，晋元帝不同意，刘隗才有所收敛。
王导带着家族二十余人，每天出来领罪。这天看见周顗，王导就喊：“伯仁，我家百口人求求你了！” 周顗看也不看，直接入殿，进殿后却极力为王导说情，晋元帝表示同意。周顗出殿后，王导又喊他，周顗不理他，乘醉对手下说：“杀了叛贼之后，在我胳膊上系上斗大的金印。”随即又上书为王导说情。王导对此毫不知情，十分憎恨周顗。
刁协、刘隗战败，晋元帝让二人逃走。刁协平时不施恩德，此时无人理睬，半路被杀。刘隗投奔后赵为官，后来死于后赵。
晋元帝派人告诉王敦：“您如果还念着晋室，现在停战，大家还可以和平共处，如果不然，我也可以让贤。”
王敦看大家都推崇太子，就想以不孝的名义废黜太子，在百官的面前厉声问温峤，太子有何德行？
温峤说，太子的智谋我无法描述，从礼节的角度看，太子也称得上孝。
大臣们都同意温峤的说法，王敦的想法没有得逞。
有人劝王敦除掉周顗、戴渊，王敦也有这个想法，就再三试探着问王导。王导不予回答。
不久，王敦杀了周顗、戴渊。
晋元帝让王敦的堂弟王彬去慰劳王敦。王彬与周顗关系很好，见到王敦后斥责王敦。王敦大怒，说你以为我不能杀你吗？王导忙劝王彬道歉，王彬说我脚痛不能下拜，再说事已至此，道什么歉？王敦威胁说，脚痛颈痛，哪个会更痛？王彬还是不道歉。
后来，王导才看见周顗为自己求情的奏疏，痛哭着说：“吾虽不杀伯仁，伯仁由我而死，我有愧啊！”
王敦擒获司马氶后将其杀死。
王敦得志后，更加残暴傲慢贪婪，官员基本都出自他的手下，其爪牙横行霸道，人们都认为他快灭亡了。
晋元帝忧愤成疾而死。太子即位，就是晋明帝。
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