本质上来说没有什么区别，都是一种支付结算方式，也都是实现了货币充当商品就按媒介的职能，但要说到具体的区别，在支付形式、支付特征以及支付局限性等方面又会存在一定的差异，也就是移动支付与刷卡支付的区别，具体有：
支付宝、微信支付本质属于移动支付，移动支付是通过利用手机等电子设备来讲行货币支付，诞生时间晚，是一种新型的支付体系，所以，支付宝、微信付款支付属于一种比较新的支付方式。而刷卡支付是比较传统的支付方式，诞生时间早，属于传统支付体系里面的银行卡支付范畴。
支付宝、微信支付依靠互联网快速发展打破了传统支付对于时空的限制，可以做到让用户随时随地进行支付活动，例如，我们可以选择任意的时间在网上进行购物或者是其他的消费行为。传统的刷卡支付需要消费者与商户之间面对面进行交易，毫无疑问，这种方式对支付的时间以及地点都有很高的要求，限制性比较大。
无论是支付宝支付还是微信支付都有较高的综合度，这体现在可以为用户提供不同的服务类型，例如：用户可以既可以通过支付宝、微信购物，又可以去缴纳水电燃气费，还可以打车出行、挂号问诊、预定酒店等等，都可以通过移动支付app来完成，服务类型综合度高且全面。传统的刷卡支付一般仅用于即时支付，服务类型综合度低且不全面，上线起来也比较困难。
支付宝、微信支付使用的人都很多，使用的频率比较高，有些人甚至一天要用好几次，而且支付宝、微信支付目前覆盖范围也比较大，已经很少有地方不能使用了。传统的刷卡支付目前使用的人越来越少，使用的频率也比较低，很多人一年也刷不了几次，有的人甚至一年到头一次都不用，而且商业银行还无法满足无对公账户的非个体工商户、个人商户以及一些摊位的业务需求，也就是消费者无法在这类场所进行刷卡，所以，传统刷卡覆盖的范围其实是比较小的，使用起来方便性也比较差。
这个影响可以从对消费者的影响、对商家的影响以及对银行、ATM厂商的影响去分析。传统刷卡支付多个人、商家、企业产生的影响已经十分有限了。相反，支付宝、微信支付不仅方便了个人付款，也降低了商家的手续费用，从而扩大了盈利空间，对银行、ATM厂商的业务也会产生影响，减缓了他们的发展速度。
对于移动支付与刷卡支付的安全性到底哪个更高？不同的人也会有不同的看法，个人认为传统的刷卡支付安全性要更高一点，移动支付目前处理快速发展阶段，也因为支付方式设置以及支付信息展示的原因，会存在更多的安全漏洞，容易造成信息泄露或者资金损失，但一般情况，只要小心去使用，安全性其实都差不多的。
支付宝、微信支付目前应用范围很广，在一般的支付情况下，这种支付方式的局限性已经很小了，依靠互联网快速发展的移动支付已经打破了传统支付对于时空的限制，可以做到让用户随时随地进行支付活动。刷卡支付处理的速度、效率都比较低，而且支付运作成本比较高，提供全天候服务相对困难，受时空限制影响较大，当然刷卡支付更容易构建自己的信用体系，这就是两者之间的具体区别吧！
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