事实上，取消中医的声音，也并非由张功耀首先发出来的，民国时期，就曾有过了废除中医的论争，最后的结果是“废医存药”的思想横行。而近年来，中医又遭遇众多的危机，中药有毒，缺乏临床验证，甚至在英国，一味中成药被检测出汞超标11.7万倍！网上以科学打假闻名的方舟子也对打击中医不遗余力，称中医是伪科学，如鲁迅所说的，是“有意或无意的骗子”。
从历史上来看，中医的存废与西医有关。西医的引进，使中国人治病有了更多的选择，这无疑是一种进步，但却同时使中医遭遇到生存危机。西医临床的疗效比中医更加明显，而且西医具有标准化的可能，不像中医，对于同种疾患，一个医师一个药房，让病人不知所措。
可以说，西医的进入使中医暴露出了缺陷，同时也让中医界陷入茫然。我们当然不相信，存在了几千年的中医是百无一用的，它有很多精华所在，而西医同样具有许多可取之处，这种状况，使人们幻想了一种可能：中西医结合、中医现代化。
不管是取消中医还是“废医存药”，其背后的意思仍是以西医一统天下。废除中医保留中药，则中药也失去了其“气”、“味”，只剩下一堆化学成分。
在中医面前，西医无疑是强势的。中医现代化的结果其实就是中医的西医化，用药治疗皆以西医理论为圭臬。如果西医与中医理论相通，那么中西医就应该有个完美的结合，然而中医与西医背后的理论系统却是天渊之别。
众所周知，中医以辨证法指导治病用药，讲究阴阳五行相生相克，以达到人体平衡为治疗终极目标，这与头痛医头脚痛医脚的西医截然不同。辨证施治是中医的最大特点，这同时要求了中医医师的辨证能力有极高的水平。辨证能力或方式不同，治疗方法也就千差万别，最终使中医陷入没有标准的缺憾。
因此，中医的辨证特点也成为了它的缺点，它深厚的文化背景使得学中医的学生望而却步，以至于中医人才日渐凋零；又因为只要自圆其说就是一个完整的辨证，所以有了
中医难以进步，又在西医的强大阴影下，已是愈加趋向边缘。所以，不用张功耀等人取消中医的签名行动，中医已如方舟子所说，正处于“任其自生自灭”的状态了。据悉，在中医高等院校里，大多数学生1/3的时间学西医，1/3的时间学英语。而在各大中医院，坚持开汤药处方的中医大夫只占1/10，西药处方占据了绝对的主导地位。
中医与西医的关系，并不是一个“不是东风压倒西风，就是西风压倒东风”的关系，中西和西医可以互相补益，但这样补益并不一定要通过“中西医结合”或“中西现代化”来实现。“西医救急救命，中医治根治本”是一个共识，应从制度上尊重中医的独特治疗方法。以西医领导中医，结果是削足适履，将逐渐丢失中医特点，使中医不成为中医，最终使人们少了中医的治病选择。
医患之间向来存在着信息不对称的事实，对于中医尤其如此。为什么有这么多人支持取消中西？除了人们对中医疗效不信任之外，也存在一个文化背景缺乏的情况，人们认为阴阳五行的辨证过于玄虚，不是碰到疑难杂症或西医治疗无效的情形下，轻易不会请中医治疗。
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