stLearn
工具官网:
- https://stlearn.readthedocs.io/en/latest/index.html
代码官网:
- https://github.com/BiomedicalMachineLearning/stLearn
简介:
开发了一种新的整合分析方法,利用三种数据类型:基因表达数据,组织形态数据和空间位置信息,首先找到细胞类型,然后重建组织内的细胞类型并推测进化路径,还可以寻找具有细胞间高相互作用的组织区域(热点区域,hotspots)
- 文献Doi :https://doi.org/10.1101/2020.05.31.125658
发表作者:Quan Nguyen 昆士兰大学分子生物科学研究所
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