众所周知，我们【生信技能树】团队这些年一直在身体力行的推广马拉松学习理念，目前唯一可行的生物信息学入门策略！是60个小时的线上全网直播视频课程，连续4个星期，每个星期5天，每天的晚上 3个小时互动授课（周三、周日休息）
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同期也安排了助教和实习生一起协助整理讲师的直播授课时间线，提炼内容梗概方便学员们查漏补缺，精准复现！
2023/02/14
12-1 Linux-文本查看、操作与统计1（01:05:27）
- 00:06:00 - 文本查看、操作、统计命令 head/tail,cat/tac,less/more;wc,sort,uniq;cut,paste,tr
- 00:06:30 - 文件查看，cat，head，tail，less
- 00:20:46 - head/tail (管道符)
12-2 Linux-文本查看、操作与统计（00:54:31）
- 00:04:14 - paste 文本合并 paste file1 file2 ；paste - -
12-3 Linux-vim的使用（01:11:18）
- 00:02:06 - vim编辑器三种模式，命令模式、编辑模式、末行模式
- 00:34:08 - vim练习布置；fasta文件格式讲解
- 00:54:40 - 提问答疑 说明Linux文件覆盖
2023/02/16
13-1 Linux-三驾马车之grep（00:45:39）
- 00:06:13 - grep简介，文本搜索工具，代码格式，常见参数w\c\v\n\r\e\f\i
- 00:13:05 - 使用example.gtf文件为示例，-w参数，学员思路互动
- 00:23:14 - -c参数、-v参数，-c参数，-e参数（可重复：关键词聚集到文件）
- 00:29:30 - 正则表达式 ^ $ . ? + * {n} {n,} {m,n} [] [^] |
- 00:31:19 - 讲解 ^行首 $行尾 .换行符之外的任意单字符
13-2 Linux-三驾马车之sed（00:44:23）
- 00:04:50 - 讲解练习1第6题（正则表达式）
- 00:17:26 - sed，文本增删改查，代码格式，n\e\f\r\i 参数（options）
- 00:19:49 - sed script：address参数 与 command 参数 a\i\d\c\s\y\p 大纲
- 00:31:33 - 思考题，同时替换3行为*************
- 00:34:58 - -s参数 , sed查找文本
13-3 Linux-三驾马车之awk（01:09:13）
- 00:09:50 - awk，处理数字和文本（字段分隔符 $），参数-F、用法（基础结构、匹配结构、拓展结构）
- 00:13:10 - 用example.gtf举例，字段分隔符，-F指定分隔符（基础模式）
- 00:19:24 - 举例匹配模式 /.../{...}
- 00:22:27 - 拓展模式BEGIN... END...,三段式
- 00:25:12 - awk内置变量 FS/RS/OFS/ORS/NF/NR简介+OFS举例、NR举例、FS举例
- 00:33:11 - 资料查询网站分享aigcfun.com
- 00:35:45 - 用example.gtf举例条件和循环语句
- 00:43:18 - awk数学运算&数学运算举例
- 00:47:37 - 思考如何使用awk实现四舍五入，布置练习3
- 00:48:57 - Linux常见符号和含义 举例
- 00:57:35 - Linux常见报错 （找不到对象，没有权限，命令不存在）
2023/02/17
14-1 Linux-conda简介与安装（00:46:11）
- 00:05:15 - conda的安装与使用，conda简介
- 00:10:19 - conda的下载（国内镜像和官网）
- 00:17:39 - 安装miniconda，添加conada频道，conda config --add, ~/.condarc
14-2 Linux-创建小环境及软件安装（01:13:00）
- 00:05:54 - 创建独立小环境，小环境增删改
- 00:12:34 - 安装哪些软件，如何安装软件，--help检查
- 00:24:33- 软件的调用，查看已经安装的软件，删除软件，conda的命令
- 00:32:41- 代码演示，安装rna和R4小环境，安装R，library()验证R包的安装，
- 01:04:09 - conda安装的常见报错，缺啥补啥，
14-3 Linux-环境变量和手动安装软件（01:08:00）
- 00:00:10 - 提问和答疑（软件安装、小环境创建）
- 00:16:55 - 环境变量 echo，home，PATH......
- 00:19:40 - echo ~/.bashrc $PATH
- 00:38:50 - 其他非conda的软件安装方式，binary，soucrce coda，java
2023/02/18
15-1 Linux-脚本编程之系统环境与变量（00:57:49）
- 00:09:25 - 命令能被执行的3个要素 推荐创建~/bin/管理命令
- 00:16:04 - Linux系统环境，文件系统结构：一切皆文件
- 00:20:22 - 系统环境：查看lscpu，free -h，df -h，du -h -d，du -sh ~,top......
- 00:34:33 - Linux变量理论知识补充，自定义变量，环境变量，状态变量
15-2 Linux-结构化语句与参数拓展（00:42:21）
- 00:00:02 - 结构化语句 if then else 数值判断，字符串判断......
- 00:17:22 - for循环 for do done,变量加{}
15-3 Linux-脚本编程之shell脚本与任务提交（01:19:06）
- 00:04:34 - 讲解结构化语句练习，之前未布置
- 00:12:34 - 脚本编辑-shell脚本，vim编辑器，#! 后面写bash所在的位置 shebang
- 00:33:26 - 参数传递，注意分开重定向log文件
- 00:45:44 - 任务提交命令总结 nohup & top htop ps kill
- 00:53:35 - tail -f 动态查看输出结果
- 01:00:15 - ps -ef | grep ， kill -9 PID
- 01:03:38 - less(shift + f) ; top | grep '$LOGNAME'
- 01:06:03 - 推荐教程：阮一峰bash、鸟哥 Linux
写在文末
如果你是生命科学领域硕博士或者博士后，但凡有导师经费支持的， 请务必至少参加一次我们的马拉松学习课程，加入我们生信技能树小圈子，你会发现科研世界从此大不一样！对我们的马拉松课程有其它疑惑也可以自行前往b站查看我们的课程介绍哈；
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