GEO数据库中国区镜像奔走相告啊

最近还是大量粉丝留言表示自己因为疫情困在家里，想做数据挖掘混个本科毕业论文，但是看完我的GEO数据挖掘视频后，想下载个数据集，就被卡死了，实在是巧妇难为无米之炊！

这个不怪大家，我给大家的免费的GEO数据挖掘视频其实录制很早了，那个时候还没有写：GEO数据库中国区镜像

b站GEO数据挖掘视频

上次推送完GEO数据库中国区镜像，反响很不错，我自己在给大家做免费数据分析的时候也是使用它。

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说明大家是认可我们的！

安装我的GitHub包AnnoProbe

因为目前 AnnoProbe 包在 GitHub，所以不要使用其它方法安装，只能是下面的 install_github 函数哦：

library(devtools)
install_github("jmzeng1314/AnnoProbe")
library(AnnoProbe)

如果你安装失败，应该是你无法连接GitHub的原因，可以考虑下载包到本地，自己去搜索解决方案吧！

本地安装GitHub包

使用方法

使用起来非常方便，就一句话，找到你的GSE数据集的ID，传给我们的函数即可，真的是完全没有门槛了！

gset <- geoChina("GSE11924")
gset <- geoChina("GSE16515")
gset <- geoChina("GSE16757")
gset <- geoChina("GSE1818")
gset <- geoChina("GSE18842")
gset <- geoChina("GSE23561")
gset <- geoChina("GSE24460")
gset <- geoChina("GSE28735")
gset <- geoChina("GSE55940")
gset <- geoChina("GSE59867")
gset <- geoChina("GSE68004")
gset <- geoChina("GSE8157")

下载后的 gset 对象就可以走我们的GEO数据挖掘流程啦！

不安装包也可以使用

运行下面的代码，加载一个函数文件即可：

source('http://raw.githubusercontent.com/jmzeng1314/GEOmirror/master/R/geoChina.R')

当然了，这个包其实功能强大

可是我的拖延症啊，开发得没完没了，现在还没有大块时间能系统性完成它！

全部的秘密在我学徒的推文里面：GEO数据挖掘流程——代码版（方便抄袭）

是不是很激动，想试试看

同样的代码，你可以处理自己的数据集哦。

因为功能非常简单，just a replacement of getGEO function from GEOquery package.

所以是不会有bug的，但是，也许大家在使用的过程有新的需求，我可以酌情根据时间来开发增加功能，感兴趣可以进入我们的交流群：4年前的TCGA重磅资料你学了吗

当然了，表达芯片的公共数据库挖掘系列更多教程，见推文；

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