lncRNA组装流程的软件介绍服务器安装IGV

咱们《生信技能树》的B站有一个lncRNA数据分析实战，缺乏配套笔记，所以我们安排了100个lncRNA组装案例文献分享，以及这个流程会用到的100个软件的实战笔记教程！

下面是100个lncRNA组装流程的软件的笔记教程

通过mobaxterm这个工具可以直接在服务器里安装运行IGV，因为mobaxterm支持X11，在运行IGV时可以接弹出一个窗口

具体安装方法如下：

# 下载liunx版IGV
wget https://data.broadinstitute.org/igv/projects/downloads/2.9/IGV_Linux_2.9.4_WithJava.zip

# 解压
unzip IGV_Linux_2.9.4_WithJava.zip

# IGV包只需要解压，不需要安装，运行解压出的文件igv.sh
bash igv.sh

不仅仅可以通过mobaxterm安装IGV，如果没有root权限，也可以通过这个mobaxterm安装R studio等之类的工具

安装方法：

首先把condarc里面的国内镜像全部停用，因为清华没有这个r的镜像，接着安装的话，我们为了避免污染环境，选择独立创建一个环境

mamba create -n rstudio -c r -c https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/ rstudio

然后激活rstudio

# 激活环境
conda activate rstudio

进入环境之后，只需要在mobaxterm里面输入rstudio，启动rstudio，我们就可以开始玩耍了

参考

https://mp.weixin.qq.com/s/ZZhj5dtq54QCGTaBu7Y65g

https://zhuanlan.zhihu.com/p/108571232

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