男,
一个长大了才会遇到的帅哥,
稳健,潇洒,大方,靠谱。
一段生信缘,一棵技能树,
一枚大型测序工厂的螺丝钉,
一个随机森林中提灯觅食的津门旅客。
随着单细胞技术的成熟,单细胞数据也在日益增长,这将为单细胞数据科学奠定数据基础。在不远的将来,单细胞数据挖掘也将成为生命科学的基础设施。只是在2020年的今天,大量的细胞图谱还处在原始的数据积累阶段,还没有像TCGA 数据库那样成熟。这就像远处的晨曦闪着的微光,早起的人总会不由自主地驻足观望。
要做数据挖掘,第一条肯定是要有数据,好在这些图谱的数据都是比较方便下载的。一般是csv,loom, cellranger 输出矩阵格式的,下载来直接用我们熟悉的单细胞工具就可以做了。
今天,你们家运来哥哥就带你看看现阶段人类已经构建的细胞图谱,走吧~
https://www.humancellatlas.org/
https://hlca.ds.czbiohub.org/
https://db.cngb.org/HCL/
https://www.proteinatlas.org/
http://bis.zju.edu.cn/MCA/index.html
https://www.gutcellatlas.helmsleytrust.org/
https://www.gutcellatlas.org/
https://www.kidneycellatlas.org/
https://www.covid19cellatlas.org/
看了这么多细胞图谱,我们也许会反问自己:到底什么是细胞图谱?
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