根据单细胞的应用方向主要可以分为三大类:
分别以“single cell,single cell RNA,single cell RNA seq, scRNA-seq”为关键词在PubMed上搜索,均可以看到近10年来,近5年来单细胞相关的文章数量增长迅速,web of science 检索的结果也是同样的趋势。说明随着技术的进步,单细胞测序成本的进一步降低,单细胞的门槛更加降低。再加上各个公司和新媒体的作用,单细胞的热度一直在增加。未来会有更多的新技术与新的分析方法产生;同时会有大量的文章会涌现出来。下图是在PubMed以scRNA-seq为关键词文章数量。
根据文章的总结,单细胞的文章结构,依据研究的内容不同,有所差异。单细胞转录组与普通转录组类似,一般为组织样本。可以只有一个样本,也可以有明确的实验组和对照组,推荐组内1-3重复。
分析思路:通常是先单独做Control细胞图谱,然后和case一起分析,也可以直接把两者放在一起分析。主要是找到新的细胞群或者亚群,根据其基因表达模式及其与疾病等表型的关系深挖它们的功能等。
根据经验和参考网上的内容单细胞文章正文一般包括以下内容:
依据单细胞的应用方向,单细胞的文章类型也可以分为三大类型:
细胞图谱、肿瘤和免疫和细胞发育。
每个类型又可以根据数据量的大小,分析的难易程度、功能的研究等分为不同的层次:
随着单细胞研究的深入,不同类别的文章将源源不断的出现。
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