RT-qPCR
一、RNA提取(0.1g组织加1000μL Trizol、200μL氯仿,取得水相等体积异丙醇)
1)实验前准备
超净台 UV 30min照射、DEPC水(经DEPC——焦碳酸二乙酯处理过的,并经高压高温灭菌的超纯水)and 75%酒精提前灭菌、冰盒、酒精喷壶(灭菌)、EP管架、离心机预冷。
2)组织研磨并溶解
称取组织于冰上加入200μL Trizol用匀浆机研磨至肉眼不可见组织残渣。继续加入800μLTrizol混匀,室温静置5min使RNA溶解。
3)离心取上清
在4℃条件下,以12000r/min的转速离心10min,取上清于另一EP管中,弃去组织残渣。
4)相分离
上清液体中加入200μL氯仿,慢摇15s,室温静置5min。在4℃条件下,以12000r/min的转速离心15min,可见原上清分离三层现象。上层水相为溶解的RNA,中间白色乳状物为有机层,下部为所加试剂。
5)取水相并加入等体积异丙醇
小心吸取水相,于另一EP管中,按照与吸取水相等体积加入异丙醇。慢摇混匀,室温静置10min。
6)沉淀RNA并干燥
在4℃条件下,以12000r/min的转速离心10min,弃去上清留下沉淀,稍微干燥(风吹)。
7)清洗RNA
加入1mL 75%的酒精(4℃),沿着EP管壁加入,轻轻震荡。在4℃条件下,以10000r/min的转速离心5min,弃去上液(酒精溶液),干燥10min。
8)DEPC水溶解RNA并保存
以DEPC水溶解RNA,并转移至-80℃冰箱保存。
二、琼脂糖凝胶检测RNA含量
1)50×TEA缓冲液的配置
以称量Tris 242g,EDTA 18.612g于1L烧杯中; 加入57.1ml的冰乙酸,充分溶解;用NaOH调pH至8.3,加去离子水定容至1L后,室温保存。(Tris-acetate提供导电性并可以保持pH值。EDTA通过螯合二价阳离子(Ca2+,Mg2+)来抑制金属依赖性核酸酶,从而在运行中保护DNA免受核酸酶的影响)
2)琼脂糖凝胶制备
将琼脂糖与TAE缓冲液以1g(琼脂糖):100ml(TEA缓冲液)比例混合,置于微波炉中,一次沸腾即可(冒出大量气泡),倾倒于制胶模具中,30min凝胶,拔出梳子。在电泳槽中倒入TEA缓冲液(3次即可更换)将制得的胶置于中间平台边缘,加样品空朝向负极。
3)点样and加样
在封口膜/PE手套上点按照样品数目+1(梯度marker)次指示marker(指示整体RNA样品处于琼脂糖凝胶的位置相当于溴酚蓝功能),每次1μL,然后依次在每个点中点入2μL梯度marker/样品,吹打后加入琼脂糖孔隙中。
4)运行
设置电压120V运行大约40min,即当指示marker跑到琼脂糖凝胶3/4区域时,停止运行。
5)紫外显影
在显影仪中进行紫外显影。
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