NGS的诞生可以说是基因组学研究领域一个具有里程碑意义的事件。相比于一代测序,NGS更加省时低成本,速度快,覆盖度深,准确度高。对于疾病引起的基因突变,NGS可以为患者医师提供更为准确的诊断依据。目前,二代测序也是现阶段科研市场的主力平台,主要应用包括DNA测序、RNA测序和表观基因研究等方面。
近年来,高通量测序技术已经日渐成为基因组学研究项目的标准。从样品制备到文库制备及最终测序,大多步骤都要求精确高效化、易于自动化操作。磁珠,作为一种新型磁性纳米材料,在高通量样本处理中的应用越来越广泛。纳米磁珠适用于自动化和高通量样本处理,例如高效提取游离血球外核酸,标记捕获超微量及痕量生物大分子,已经广泛应用于唐氏筛查、肿瘤分子和免疫检测、细胞免疫治疗等领域,当前90%以上的产品种类依赖进口,被称为生物医学领域的'芯片级’原料。
海狸作为国内较早期从事纳米磁珠技术和产品开发的国家级高新技术企业,近10年来,专注于纳米磁珠技术自主研发,从第一代弥散结构纳米磁珠技术,第二代核壳结构二氧化硅磁珠,到第三代多夹层结构聚合物磁珠,不断取得技术突破,持续进行产业升级。
二代测序工作流程:
在NGS整个流程中,有两款磁珠是必不可少,包括片段筛选和探针捕获磁珠
表1. 磁珠在二代测序中的应用
行业现状
片段筛选磁珠
片段筛选磁珠最早是由beckman通过SPRI磁珠技术开发,近几年国内外稍微有了些品牌,比如Clean NA,Omeaga等。但是国产很少有品牌能够跟Beckman AMpure XP 1:1替换。海狸技术团队,采用纳米材料和生物技术双轮驱动,经过3年多的技术开发和反复验证,推出了DNA片段筛选磁珠,其具备:高纯度,精准筛分,良好操作性能特点。在DNA建库应用测试中,BeaverBeads® DNA Select Isolation的片段回收范围与进口品牌相同,片段回收效率偏差<3%,可实现进口产品1:1替代。
有图有真相,且看DNA建库应用测试
结论:从DNA文库中筛选300-500bp和500-700bp范围的片段,BeaverBeads® DNA Select Isolation的片段回收范围与进口品牌相同,片段回收效率偏差<3%,可实现进口产品1:1替代。
探针捕获磁珠
探针捕获磁珠,基本上使用链霉亲和素磁珠,目前几乎使用进口磁珠,如Dynabeads M270。国内几乎无替代。海狸深耕纳米磁珠技术10多年,经过三代技术革新,推出了多层结构的链霉亲和素磁珠。其具备:低背景,高载量,粒径均一特点。
2.8μm磁珠电镜图
有图有真相,且看核酸探针捕获对比测试
测试结果显示:核酸探针结合量与进口磁珠相当,目的核酸探针捕获效率达到进口磁珠的90%。
当前二代测序中磁珠原料90%以上的产品种类依赖进口,海狸作为早期国产品牌磁珠厂家,将进一步加大第三代化学发光及免疫捕获磁珠的规模化量产,定位全球市场,致力打造纳米磁珠材料领军品牌。
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产品名称
规格
订货号
链霉亲和素磁珠(300nm)
10 mg/mL, 300nm
22308
链霉亲和素磁珠(2.8μm)
10 mg/mL, 2.8 μm
22309
链霉亲和素磁珠(1μm)
10 mg/mL, 1μm
22307
DNA片段筛选
5 mL、60 mL、60 mL
70407
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