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《Cell Res》新论文纠正教科书,发表首发性成果

这项工作纠正了二十多年来在细胞色素c氧化酶的结构生物学研究中的错误,拓展了对细胞色素c氧化酶的认识与理解。



清华大学生命科学学院杨茂君教授研究组在《细胞研究》(Cell Research)在线发表题为《14个亚基组成的人源细胞色素c氧化酶的完整结构》(Structure of the intact 14-subunit human cytochrome c oxidase)的研究论文,首次报导了人源细胞色素c氧化酶(呼吸链复合物IV)的完整结构,分辨率达到3.3。完整的人源细胞色素c氧化酶由14个亚基组成一个单体,而不是教科书中所认为的两个13个亚基组成的二聚体,这项工作纠正了二十多年来在细胞色素c氧化酶的结构生物学研究中的错误,拓展了对细胞色素c氧化酶的认识与理解。


呼吸作用是细胞内最基本的能量代谢活动之一,生物体摄入的有机物在细胞内通过一系列生化反应后生成水、二氧化碳和其他产物,并释放出能量。线粒体呼吸链位于线粒体的内膜上,包含四个膜蛋白复合物以及电子传递配体辅酶Q和细胞色素c等。这四个蛋白质复合物分别是复合I(NADH脱氢酶),复合物II(琥珀酸脱氢酶),复合物III(细胞色素c还原酶)和复合物IV(细胞色素c氧化酶)。线粒体呼吸链将电子转移到氧的同时,把质子泵到线粒体膜间隙内产生质子梯度并驱使ATP合成酶(复合物V)合成能量分子ATP。


自1995年原核细胞色素c氧化酶的结构被解析以来,从原核至真核,从简单到复杂,复合物IV的结构不停涌现。与此同时,科学界一直认为细胞色素c氧化酶是一个同源二聚体,由两个各包含13个亚基的单体组成。但是在本工作中,通过使用冷冻电镜收集数据并处理后,杨茂君教授解析了人源细胞色素c氧化酶迄今为止分辨率最高的结构。通过对过往实验结果的归纳总结和对新获取的数据进行分析,杨茂君教授在3.3的电子密度中搭建出了细胞色素c氧化酶的第14个亚基NDUFA4以及与它相互作用的心磷脂,首次确定了完整的细胞色素c氧化酶的各个亚基的位置,并提出了完整的细胞色素c氧化酶是由14个亚基组成的并以单体形式存在。


在杨茂君教授解析的呼吸链超级复合物结构中,细胞色素c氧化酶的组成状态均为单体,生化实验中抽提纯化出的细胞色素c氧化酶也均为单体,但是过往的晶体结构中细胞色素c氧化酶都是同源二聚体。


在这项工作中,杨茂君教授发现了第14个亚基NDUFA4,它处于二聚的晶体结构中的二聚结合界面上,并有一个心磷脂分子与它相互作用。


在过往的晶体结构研究中,纯化的步骤使用了性质较强的去垢剂,导致稳定结合在细胞色素c氧化酶中的心磷脂分子被替换掉,而NDUFA4也从细胞色素c氧化酶解离出来。这样形成的二聚的细胞色素c氧化酶与体内的状况不一致,也导致学术界一直认为细胞色素c氧化酶是一个同源二聚体。NDUFA4结构的解析解决了这个矛盾,并解释了晶体结构中细胞色素c氧化酶二聚的原因。


在这项工作中杨茂君教授还发现,与之前牛源细胞色素c氧化酶不同,Cox7A2、Cox6A1和Cox8A分别替代了亚基Cox7A1、Cox6A2和Cox8B,这三个亚基的结构首次被解析。


原文标题


Structure of the intact 14-subunit human cytochrome c oxidase



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