硬核测序！新发文利器、英国维康桑格研究所实名点赞、大数据样本护航，这个技术究竟有多刚？！

编者按

单细胞转录组解决了以下两个问题：

1. 细胞量太少：对于一些珍贵的、本身含量少或者取样非常困难的样本，细胞数有时只有上百个甚至几十个，难以提取足够的RNA用于常规转录组测序。

2. 细胞异质性高：常规转录组测序，细胞间的差异往往被平均值掩盖，而单细胞转录组可以精确到单个细胞之间的转录水平差异，满足生殖细胞、肿瘤组织等细胞异质性很强的研究需求。

有了单细胞转录组测序，这些问题迎刃而解，真是大快人心！

作为专注前沿技术的科研服务机构，单细胞转录组自然也是华大科技研发的重中之重。华大科技利用自主测序平台，结合多年单细胞项目经验，整合推出BGISEQ单细胞真核转录组，在短时间就取得多项成绩，频频引发关注。

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英国维康桑格研究所发文亲测，BGISEQ单细胞转录组数据质量优

2018年11月，在杂志《bioRxiv》^[1]上，英国维康桑格研究所和欧洲生物信息研究所等正式发表了文章《Comparative analysis of sequencing technologies platforms for single-cell transcriptomics》。文章选用468个单细胞来做测试，有mESCs和K562两种细胞类型，Fluidigm C1和plate-based两个捕获平台组合，对比了I公司平台和BGISEQ-500平台单细胞转录组测序数据各个指标。由图1中可以看出BGISEQ-500平台在基因定量的灵敏度和准确度上表现优秀，与I公司平台高度一致。

图1 BGISEQ-500平台和I公司单细胞转录组数据灵敏度和准确度统计（图片引述自英国维康桑格研究所相关文章）

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全年执行项目大数据统计，BGISEQ单细胞转录组指标优异、更稳定

2018年，BGISEQ单细胞转录组全年一共完成了1363例样本，科技君对2018年的下机数据及分析结果进行了统计。

1）BGISEQ平台与H平台产出数据在Q20和Q30值基本一致。在产出数据质量稳定性上，BGISEQ平台略优于H平台。

图2 BGISEQ平台与H平台数据质量比较

2）BGISEQ平台的clean data rate平均值在99%以上。clean data是指raw data去除低质量reads、包含adapter的reads和N过多的reads后的data。由clean data rate可以看出BGISEQ转录组的低质量数据和含adapter数据比例极低。

图3 BGISEQ数据的Clean data rate统计

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BGISEQ单细胞转录组集合周期、实验、平台等多重保障，省心放心

周期有保障

2018年，BGISEQ单细胞转录组项目及时交付率达到99%，样本类型包括大鼠、小鼠、人、昆虫等。

实验有经验

实验技术专家操刀，使用高效、低创的口吸管法对单细胞进行分离，搭配华大独创的单细胞裂解液，强强组合最大限度保证mRNA的完整性。

采用Fluidigm C1平台进行单细胞捕获、裂解、反转录及预扩增，改进后的Smart-seq2扩增技术能实现对单细胞级别RNA进行高效、高保真扩增，覆盖度高，低表达基因的检出率高。

平台有实力

BGISEQ平台无index hopping担忧。2018年6月11日《bioRxiv》发表了文章^[2]，指出BGISEQ仅使用单个index就实现了0.0001％至0.0004％低样本错误分配率。

BGISEQ平台发表文章已超200篇，其中转录组和RNA-Seq在《Nature》《Cell》《Immunity》《Nature Neuroscience》等顶级期刊都发表过多篇文章。

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BGISEQ单细胞转录组，分析交付已升级为Dr.Tom！

现已升级为Dr.Tom交互式系统交付报告，从此不用反复请人帮忙作图改图，鼠标一点，玩转转录组数据挖掘。Dr.Tom还可以用于其他相关数据的分析，不用担心手头庞大的测序数据浪费。

新学期促销福利

BGISEQ单细胞真核转录组促销，

8.3折优惠（样本数≥10个），

等于签10个样本，送2个样本！

真买真打折，价格不含糊！

活动时间：即日起-2019年4月30日

活动详情请咨询当地科技代表。

参考文献：

[1] Natarajan KN, Miao Z, Jiang M, et al. Comparative analysis of sequencing technologies platforms for single-cell transcriptomics. bioRxiv, Posted November 05, 2018. doi: https://doi.org/10.1101/463117.

[2] Li Q, Zhao X, Zhang W, et al. Reliable Multiplex Sequencing with Rare Index Mis-Assignment on DNB-Based NGS Platform. bioRxiv, 2018: 343137.

*活动解释权归深圳华大基因股份有限公司所有

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撰稿：赵   青

编辑：市场部