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单基因泛癌表达(TCGA+GTEx)

之前我们发布了单基因泛癌分析相关的文章,包括

TCGA单基因免疫相关泛癌分析

TCGA单基因免疫相关泛癌分析-进阶版本

TCGA单基因泛癌分析:富集分析结果答疑

这里有单基因在每种肿瘤中的表达图,仅限于TCGA数据库,而这还不够完美,一方面不能用一张图同时展示基因在泛癌中的表达,一方面TCGA中有些肿瘤类型没有正常组织。

有很多已经发表的文章用到了这样一个图,这张图是在线数据库导出的图,比如:

这样的图多不胜数。而这个图也仅仅是利用TCGA数据,部分肿瘤缺乏正常组织,部分肿瘤正常组织太少。于是我们模仿出了这个图,并且使用的是TCGA+GTEx的基因表达数据,绝大部分肿瘤都具备了正常组织。比如:

公众号专题

TCGA/GEO数据分析R语言绘图
R语言学习SCI论文写作

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