ImageJ进行荧光强度测量

导    言

ImageJ是一个很强大的图片处理工具，那么对于我们平时拍的带有荧光色彩的图片，想要测量荧光的强度用来进行定量描述，这些都可以用ImageJ来进行完成，如下图所示，我们可以对其进行荧光强度测定。

软   件

FIJI

图文教程

1. 这里我们使用软件内置的图片进行教程的素材，选择荧光细胞的图片进行接下来的分析。

2. 首先将图片进行拆分成单通道的图片才可以进行测量，先点击更改通道。

3. 然后点击拆分通道

4. 就会出现三个通道的图片

5. 我们选中第一个图片C1，选择阈值

6. 选择默认值，勾选Dark background，如果觉得没选中或者选的不好，可以调节上下两个滑动的按钮进行选择，或者选择其他算法。

7. 此时图中的荧光就会被选中。

8. 接下来我们选择要测量的指标，选择Analyze里面的设置测量参数。

9. 勾选平均密度值，限定到阈值，展示标签即可。因为我们所测量的面积，是通过threshold产生，以此来确定我们所需要的测量的选区，所以需要勾选Limited To Threshold，同时有C1，C2,C3多张图片在测量，所以把Display Label也勾选上，以此进行区别。

10. 然后，我们点击一下测量，看看结果。或者直接按快捷键Ctrl+M，即可进行测量，此时就会出现我们需要的C1区的荧光强度。

11. 同理，我们进行C2和C3的测量，得到结果。

12. 所以，这张图片的荧光强度就是C1，C2和C3的总和，直接相加进行作图即可。怎么样，学会了么？

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用PPT跟Cell子刊学机制图

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GraphPad Prism绘制的小提琴图

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GraphPad Prism绘制带散点的柱状图