安捷伦片段化分析仪，核酸分析界非常炸裂的存在！

安捷伦片段化分析仪，英文全称Fragment Analyzer，简称FA。 又因为其基于毛细管电泳原理（ capillary electrophoresis），又被部分客户简称CE。该仪器的前身是美国Advanced Analytical Technologies（AATI）公司研发生产的新型突变检测及核酸片段分析系统，在2018年被安捷伦收购后，被整合进安捷伦的自动化电泳系统产品线。

仪器型号：

检测原理：

毛细管阵列是片段分析仪系统的基础。填充凝胶后，首次进样施加电压，然后将DNA 和 RNA 样品根据其分子量大小通过各个毛细管实现分离。当片段通过检测窗口时，高灵敏度电荷耦合检测器 (CCD) 采集片段的分子量和浓度信息，然后在 ProSize 数据分析软件中显示。毛细管阵列有三个规格：12阵列（长度为22cm，33cm和55cm），48阵列（33cm）和96阵列（33cm和55cm）。

图 1 片段化分析仪检测原理。A)毛细管阵列；B)片段化分析仪结构

检测参数：

• 样本操作软件：Fragment Analyzer controller software

• 数据分析软件：ProSize

• 通量：最高96*3

• 分辨率：最高3bp

• DNA最长分辨率：60kb

• DNA分析灵敏度：LOD 5pg/µl

• RNA最长分辨率：10000nt

• RNA分析灵敏度：LOD 50pg/µl

• 上样量：1-2µl

• 资质：IQ/OQ

优势：

• 通量灵活可变：可根据需求选择合适的阵列， 12、48 或 96 根毛细管。

• 通用性强：同时设置两种不同的凝胶，可自动分离完全不同的样品类型

• 高分辨率和高灵敏度：皮克级别的核酸检测灵敏度，300bp以内可分辨3bp

• 针对不同应用配有相应的试剂盒：NGS、PCR、cfDNA，mRNA，小RNA等众多应用都可以提供准确的核酸评估方案以确保获得出色性能。

• 自动化程度高，可做到无人值守

结果展示：

样本质控参数：

片段化分析仪和安捷伦经典的2100生物分析仪一样，提供数值化评估样本质量的指标。

• RQN = RNA Quality Number – RNA质量参数，与RIN值相似, 算法会有所差异。相关性测试表现出RQN和RIN值一致性。

• GQN = Genomic Quality Number – 基因组质量参数，用户可以设置片段大小阈值，以评估特 定样品类型的质量。测量计算超过阈值的DNA量。与DIN值算法不同。

• DQN = DNA Quality Number – DNA质量参数，与GQN类似，仅针对有Upper和Lower markers的试剂盒。

• DV200 = Deviation Number 200 – 由Illumina开发用于评估FFPE RNA样本质量。测量计算超出阈值的RNA量

应用：

• NGS文库构建流程质控:可用于检测样本DNA 和RNA 完整性质控，核酸样本片段化，接头连接以及最终文库的质控。

• mRNA疫苗与药物开发流程质控： 可用于模板DNA，体外转录RNA 等质控

• 检测宿主细胞残留DNA（HCD）

• 用于分子育种领域（SSR, Tilling）

• 用于三代测序质控与长片段分析

• 微量（低至飞克级）核酸样本分析