在水产养殖业中，尤其是对虾养殖业中，控制病毒和寄生虫病仍然是比较困难。由于虾缺乏适应性免疫系统，依靠先天免疫系统来预防，清除疾病感染，这种免疫系统相对单薄。在其他水生动物中使用的几种常规方法，例如：接种疫苗，但是这种方法对虾的影响有限，并且可能难以制造和实施以有效保护大量的虾群。
澳大利亚一组研究人员，分别是Nofima，Benchmark Genetics Norway AS，Benchmark Genetics Colombia和墨尔本大学的研究人员探讨，如何将自然遗传变异与DNA技术的最新技术结合起来，利用基因组选择最佳的亲虾，以便保护虾苗免受疾病侵害。
一、养虾与疾病存在的关系。
我们知道，水产养殖中，最棘手的病毒和寄生虫病存在自然遗传变异。特别是在虾类养殖当中，白斑综合症病毒（WSSV）是南美白对虾的一种传染性极强、致死性极高的疾病，每年给全世界虾行业造成数十亿美元的损失。
白斑病可以在虾感染后数天内，让整个虾塘死亡率达到100％。大量事实证明，任何预防、治疗措施都是收效甚微。比如在2016年底，澳大利亚首次发现在南美白对虾当中发现白斑病，该病传播速度极快，短短的时间内从养殖场迅速传播到昆士兰州其他养虾场。
这次白斑疾病的传播得到昆士兰州极大的关注，该州启动了有史以来规模最大的水生动物疾病应急响应，耗资440万澳元，几乎耗尽了澳大利亚的消毒剂，据相关媒体报道大约有380万升消毒剂被用于清洁池塘和水源。但是，该病依然导致澳大利亚整个虾行业暂时陷入停顿，大概造成约4亿澳元的损失。
2020年4月份，该病再次在澳大利亚的养殖出现，同时感染了两个养殖场，造成部份虾农恐慌。因此，与世界其他地区一样，澳大利亚迫切需要一种有效解决方案，来帮助虾农控制这种病毒。
二、虾免疫学和基因组
虾和其他甲壳类动物一样，都是缺乏免疫记忆，因此为促进免疫反应而进行的接种疫苗，对避免病毒的侵扰效果甚微。虽然有些动物天生就具有比其他动物更好的抗病毒能力。但是，我们并不真正了解造成这些差异的具体机制。
为了提高抗白斑病毒的能力，一些学者通过常规方法（即：先让种虾感染白斑病毒之后，存活下来的种虾对白斑病毒可能具有一定的免疫力，也就是SPR亲虾），这样传统做法，有可能繁殖出对白斑病具有更大抵抗力的虾苗，但时这种研究进展缓慢。业界迫切需要更好，更快的解决方案。
因此，研究人员正在努力，通过更加有效的方式（基因组），来提高南美白对虾对疾病的抵抗力。
该研究的一位人员表示：“我们研究不是依靠虾对抗疾病的最终存活率，来获取最佳的亲虾，而是使用DNA序列数据，来估计上成千上万个体之间的基因组关系，来确定最佳的亲虾，这种方法更加有效，便捷！”
一些被测序的虾受到了白斑病毒的攻击，这些动物对感染的反应，加上基因组关系数据，可以用来为我们提供一种更准确的方法来预测虾对疾病的抵抗力。基因组选择育种相对于传统育种的一个巨大优势是，它使我们能够更准确地预测哪些亲虾具有最佳的总体抗性基因型，而不使候选亲虾感染疾病，再以虾的最终存活率，判断哪些亲虾更具有抗病能力。
三、基因组选择育种的力量
在哥伦比亚Benchmark Genetics实验的一项针对两种亲虾（一种基因组选择育种、一种是传统育种）的实验，该实验分为两组，第一组是两种亲虾感染病毒后，获取虾最终的存活率；另一组两种亲虾处于较低的生物安全状态下，获取虾最终的存活率。
通过分析两种亲虾的基因组变异，研究人员可以分析哪种方法选育亲虾更加具有价值。
结果研究发现，在对白斑综合征病毒进行了一次的基因组选择后，亲虾的平均存活率就达到51%，比传统选育亲虾的38%，还要要高的多。
最终研究人员表示：虽然这次研究亲虾的存活水平略低于60％，似乎不能令人满意地用于商业化生产。然而，由于羊群效应，就像给人接种疫苗的效果一样，可以有效地保护人群而无需给每个人接种疫苗，而且我们也可以通过多次基因组，来提高亲虾的抗病能力。相对于传统育种方法，使用对抗疾病存活下来的虾，作为亲虾使用是存在很高的风险，因为他们可以垂直传播病毒，并且有可能传播至后代，因为目前为止，没有研究明确传统育种方法，不会传播病毒。
与传统方法相比，基因组数据的使用可以更有效的提高人们对遗传基因认识，并将亲虾选择的准确性提高到商业水平。这也是南美白对虾史上，首次研究证明从基因组选择中可以获得更佳优良的亲虾。
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