塑料降解基因来了

凌恩生物一直致力于宏基因组数据挖掘服务，2022年继抗性基因分析和元素循环分析之后，又推出生物降解塑料基因分析。

塑料的广泛生产和使用，加上塑料的长期耐用性和废物管理不善，造成了环境的不断累积。塑料会损害海洋生物，损害食物链底部的物种，影响到地球上最大的动物。微生物降解法是一种环保的降解法，近年来越来越多关于微生物降解塑料的文章发表。

因为塑料聚合物通常太大，无法穿透细胞膜，微生物需要分泌生物降解酶到环境中来分解塑料。因此，评估蛋白质降解塑料的潜力的一个关键信息是这些蛋白质是否分泌，使用Signalp 5.0软件对信号肽进行搜索。

图1 数据库中所有微生物及其各自塑料降解报告的交互式系统发育树

数据库中的蛋白质根据降解的塑料类型进行分类，在计算机上进行预测，并且可以可视化或下载以供进一步研究。除了搜索、过滤和检索数据库记录等标准数据库功能外，还提供了几种接受输入的分析工具，包括基因、基因组、宏基因组、转录组、宏转录组和分类表数据，以了解塑料降解物种以及来自这些物种的潜在塑料降解蛋白质和途径的存在。

图2 降解塑料的微生物种类的数量、蛋白质种类的数量

总之，本次升级提供了一个全面的降解各种塑料的微生物和蛋白质分析。用户可以利用服务器的分析工具在其数据集中调查塑料生物降解的多个方面，包括塑料生物降解的微生物和蛋白质的识别、不同数据集中塑料生物降解潜力的比较等，生成图形和表格进行可视化。

Tips: 

凌恩生物宏基因组分析团队提出精准个性化服务理念，查找客户关心的核心基因，突破宏基因组发文瓶颈，挖掘数据宝贵资源，为客户提供完整思路。凌恩-盈飞团队致力于为生命科学领域客户提供国际领先的数据管理和分析解决方案，具有强大的生物数据库搭建能力，结合宏基因组个性化分析内容，让您的成果展示更上一层楼。

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参考文献

PlasticDB:a database of microorganisms and proteins linked to plastic biodegradation.

Database,2022.