取样使用的工具及容器必须经过灭菌处理;
取样后及时做好标记,记录取样相关信息;
样本送测前做好备份,防止意外发生丢失珍贵样本;
送测样本使用标准容器承装,在容器上标记清晰,送样不宜过多;
寄送时保持低温环境,建议使用干冰配送;
可使用凌恩微生态样本保真液,高品质样本是决定高品质研究成果的第一步。
(1)作物类(含草地等矮小植物)根际土壤取样方法
a. 采集植物植株,去除根部大块土壤,置于冰上运输至实验室;
b. 晃动根部,去除根部松散的土壤后,使用无菌刷子从根部收集残留土壤;
c. 同一样方多点取样土壤样本等量混合均匀后,液氮速冻,置于-80℃冰箱保存。
(2)林木类根际土壤取样方法
a. 采集地面下 10-20 cm 根际土壤,置于冰上运输至实验室;
b. 过 2-5 mm 孔径无菌筛网;
c. 同一样方多点取样土壤样本等量混合均匀后,液氮速冻,置于-80℃冰箱保存。
若不能自行提取,可置于干冰寄送至公司提取。
注:取样器具请事先消毒灭菌处理。若为真菌根际土壤,请务必尽可能去除菌丝体残留,减少对 DNA/RNA 提取的干扰。
使用空气抽滤机,使空气通过 0.22 μm 滤膜,滤膜上有可见覆盖物(过滤时间越长,收集的空气中的灰尘越多,菌数量越多),收集完成后取下滤膜。滤膜置于冻存管中,液氮速冻,干冰寄送到实验室。
送样量:扩增子直径3-4cm滤膜1-2张;宏基因组直径3-4cm滤膜>=2张;
(1)研究目的进行确定水体的取样深度和范围;
(2)采样后进行滤膜过滤,选择合适孔径的滤膜,对于澄清水体或者略浑浊水体,选用0.22μm或者0.45μm的滤膜,取样体积大于5L;对于浑浊水体,建议先用大孔径的滤膜过滤一遍,再用小孔径的滤膜过滤;
(3)水体泥样的采集提供大于5g样本;
(4)用大体积干冰运输,且要保证我方在收到样品开箱检验时有足够的干冰剩余。
注意:扩增子项目将2-3L水体过滤到1-2张滤膜(0.22或0.45um)后装入到离心管中;宏基因组项目将10L水体过滤到>=2张滤膜(0.22或0.45um)后装入到离心管中。
(1)活性污泥
从活性污泥装置中取大于10 ml的悬浮污泥样本(约5-10 g沉降物),保存无菌EP管中,放入液氮或置于冰上,立即运至实验室进行核酸提取,或-80℃保存备用。
注:若液态污泥样本沉降物较少,可适当增加取样量。
(2)水体/地表沉积物
取距离水底/地表0-10 cm(具体按实验需要而定)的沉积物5~10 g,保存无菌取样袋或EP管中,置于冰上运送至实验室进行核酸提取,或-80℃保存备用。若不能自行提取,可置于干冰寄送至公司提取。
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