今天给大家介绍的一篇文章题目为“Establishing a Prognostic Signature Based on Epithelial-Mesenchymal Transition-Related Genes for Endometrial Cancer Patients”(建立基于上皮-间质转化相关基因的子宫内膜癌患者预后特征)。
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引言
上皮-间充质转化(EMT)是肿瘤细胞从上皮状态向间充质状态发展的一个连续过程。EMT参与肿瘤的发生、增殖潜能和对治疗的抵抗等多种功能,从而影响患者的生存时间。这项研究的目的是为子宫内膜癌(EC)建立一个EMT相关的预后特征。
研究方法
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图一:在训练,测试和整个集合中鉴定和验证 EMT相关基因签名。
通过风险评分和热图重新排序的每个样本的风险曲线和散点图显示了训练集(A) ,测试集(B)和整个集(C)中低风险组和高风险组中10个ERG的表达谱。每个正方形代表一个临床样本,其颜色与基因表达有关。基因表达越高,颜色就越深(红色代表上调的基因,蓝色代表下调的基因)。
在训练组(D,G) ,测试组(E,H)和整个组(F,I)中10个ERG的预后因素的曲线下的 Kaplan-Meier 生存曲线和面积(AUC)值。
(G)PCA揭示了训练集(J),测试集(K)和整个集(L)中高风险组和低风险组之间的差异。EMT,上皮-间质转化;ERG,EMT相关基因;PCA,主成分分析。
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图二:EC患者危险评分预后的亚组分析。
(A)按年龄,分级,组织学类型和分期分层的EC风险评分盒图。
(B)不同年龄、(C)不同分级、(D)不同组织学类型、(E)不同分期患者危险评分的预后价值。
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图三:食管癌患者生存预测线性图的构建。
(A)结合特征与临床病理特征(组织学类型,临床分期和风险评分)的列线图。
(B)ROC1年、3年和5年总生存期(OS)曲线,表明基于ERG的特征比其他临床因素具有更好的预测能力。此外,当将危险评分与临床因素结合分析时,5年OS的AUC值进一步增加,这表明列线图对EC 的长期预后具有优越的预测能力。
(C)校准图显示列线图预测的生存概率与实际观察到的比例非常接近。
(D)ERG和现有EMT相关签名的AUC。EC,子宫内膜癌;ROC,ROC曲线;EMT,上皮-间质转化;ERG,EMT相关基因;AUC,曲线下面积。
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图四:免疫细胞浸润景观。
(A)高危组和低危组16种肿瘤免疫相关细胞的比较。
(B)高风险组和低风险组13种免疫相关功能的比较。
(C)高危和低危人群HLA相关基因的分布。
(D)高危组和低危组ESTIMATES评分、免疫评分和间质评分的比较。
(E)风险评分与 ESTIMATES 评分,免疫评分,基质评分,RNAss 和 DNAss 之间的关系。
(F)10种ERZ与免疫细胞浸润的相关性。
(G)不同免疫浸润亚型危险评分的比较。EC,子宫内膜癌;ROC,ROC曲线;EMT,上皮-间质转化;ERG,EMT相关基因;AUC,曲线下面积;HLA,人类白细胞抗原。
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图五:EC患者高危组与低危组免疫特征的比较。
(A)数据库估计高风险和低风险组中21种免疫细胞的浸润。
(B,C)不同危险组间肿瘤浸润性免疫细胞的比较。
(D)风险评分与肿瘤浸润免疫细胞的相关性。
结论
总之,我们建立了一个基于10个ERG的EC患者特征模型,并验证了其独立的预后价值。此外,它可能为预测免疫检查点抑制剂和化疗药物的个体化反应提供参考。
参考文献:Lu KH, Broaddus RR. Endometrial Cancer.
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