今天小料君给大家介绍的一篇文章题目为“Damage-associated molecular patterns and sensing receptors based molecular subtypes in malignant pleural mesothelioma and implications for immunotherapy”(恶性胸膜间皮瘤损伤相关分子模式和基于感受器的分子亚型及其在免疫治疗中的意义)。
引言
恶性胸膜间皮瘤(MPM)的特点是一个令人难以置信的侵袭性形式的癌症与阴暗的诊断和缺乏特定的生物标志物和治疗选择。对于MPM患者,免疫治疗的有效性可能受损伤相关分子模式(DAMP)诱导的免疫原性细胞死亡(ICD)的影响。这项工作的目的是创建一个与DAMP相关的分子图谱来分类MPM患者,并预测其预后和对免疫治疗的反应。
研究方法
图一
图一:数据分析过程的流程图。
图二
图二:K-均值分析在DAMP相关亚型鉴定中应用。
(A-C)K=2为一致性聚类的最佳值。
(D)来自训练队列的MPM患者(n=397)的DAMP相关亚型。热图显示两个子类型的归一化富集分数。
(E)训练队列中两种亚型之间的总生存期(OS)的Kaplan-Meier曲线。
图三
图三:两种亚型DEG的GSEA分析。
(A)炎性DAMP亚型患者的规范途径,标志性基因集的GSEA分析。
(B)核DAMP亚型患者的经典途径,志性基因集的GSEA分析。
图四
图四:炎性DAMPs和核DAMPs亚型中DEGs的GSVA分析。
(A)炎性DAMP和核DAMP亚型患者的经典途径的GSVA分析。
(B)炎性DAMP和核DAMP亚型患者基因本体(GO)的GSVA分析。
(C)炎性DAMP和核DAMP亚型患者标志基因组的GSVA分析。
图五
图五:两种亚型免疫微环境状态及免疫特征表达水平的比较。
(A)DAMP相关亚型中22种CIBERSORT免疫细胞类型的差异估计比例。
(B)DAMP相关亚型的基质评分。
(C)DAMP相关亚型的免疫评分。
(D)估计训练队列中两个亚型之间的评分差异。
(E)两种亚型之间的表达差异。
结论
总之,我们根据MPM ICD相关DAMPs及其相应受体的表达,通过K均值分析鉴定了两种分子亚型。这两种亚型的特征性信号通路和不同的免疫状态导致了不同的预后和免疫检查点抑制剂的疗效。我们的研究提供了一种新的方法来预测预后,并确定MPM患者的潜力,以受益于ICI,并提供了一个新的视角,以提高MPM患者的免疫治疗的疗效原发性抵抗ICI。我们的工作在MPM精确治疗的发展过程中向前迈进了一步。
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