今天介绍的文章为“Novel Implication of the Basement Membrane for Breast Cancer Outcome and Immune Infiltration”(基底膜对乳腺癌预后和免疫渗透的新意义)。
引言
乳腺癌患者的治疗失败主要归因于术后进展和治疗抵抗。然而,一个有效的预后特征,以识别这种人口孤立。基底膜(BM)已被证明与癌症的进展和转移密切相关,并有可能成为乳腺癌的有力预测因子。
研究方法
一:乳腺癌候选BM基因的筛选。
(A)TCGA-BRCA,METABRIC和GSE96058共享的BM基因的维恩图。
(B-C)在TCGA-BRCA中鉴定的差异表达的BM基因的热图。
(D)前20个BM基因的体细胞突变图。
(E)显示TCGA-BRCA中OS的单变量分析的图。
(F-G)由LASSO Cox回归分析选择的6个标记BM 基因。
(H)描绘了六个标记基因位置和表达水平的Circos 图。
(I)乳腺癌六个标记基因的相关图谱。
二:6个标记基因mRNA表达水平的测定。
(A-B)用直方图定量每个基因的相对表达,并在来自乳腺癌患者的细胞系和组织中归一化为β-肌动蛋白。
三:建立和验证BM相关特征预测乳腺癌患者的临床结果。
(A)TCGA-BRCA的计算主成分分析。
(B-C)TCGA-BRCA分析患者生存状态和生存时间的分布。
(D-G)总生存曲线以及TCGA-BRCA中无病生存,疾病特异性生存和无进展生存的KM绘图曲线。
四:乳腺癌患者骨密度评分与临床指标的相关性研究。
(A-C)盒图水平改变临床指标。
(D)显示TCGA-BRCA中BMscore与临床因素之间关系的热图。
五:骨密度评分对乳腺癌耐药性的影响。
(A-C)TCGA-BRCA的BMscore与治疗敏感度关系。
(D-F)METABRIC的BMscore与治疗敏感性之间关系。
结论
总之,本研究中的BM相关基因标记是一个实用的预后指标,可以使评估乳腺癌患者的生存结果有明显的差异。此外,来自乳腺癌患者的临床组织样本证实了BMscore与EMT活性之间的强烈正相关,这增强了基底膜在乳腺癌中的新意义。
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