——生物学背景——
表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)是一种酪氨酸激酶受体,主要的生物学功能是转化增殖信号,EGFR基因的突变将会导致非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)。比较常见的EGFR的突变有外显子19位置处的5个氨基酸残基(E746-A750)删除和外显子21位置处L858R的单个氨基酸突变,这些都会造成非小细胞肺癌患者肿瘤的进一步发生和发展。
使用EGFR酪氨酸激酶的抑制剂可以靶向抑制这两种突变体,第一代的EGFR抑制剂有gefitinib等,然而在用药后,EGFR通过gatekeeper处的T900M突变来产生抗药性;下一代的药物osimertinib通过共价结合Cys797来抑制L858R/ T790M 和 del19/T790M EGFR这两种突变体;在使用osimertinib后,非小细胞肺癌患者仍然会通过不同的机理来产生抗药性,这其中最主要的是C797S的突变,弱反应性的丝氨酸取代半胱氨酸后,将不能结合osimertinib的丙烯酰胺共价头。
图一:不同EGFR抑制剂的化学结构
2021年8月帕尔马大学的Marco Mor课题组在EJMC上发表文章,“A sulfonyl fluoride derivative inhibits EGFRL858R/T790M/C797S by covalent modification of the catalytic lysine”,发现了芳基磺酰氟类化合物可以共价结合到Lys745来抑制此类突变体的活性。
——设计策略——
XO44是一个已报导的含有磺酰氟结构的广谱性激酶profiling的探针,并且其与EGFRL858R/T790M/C797S存在共晶结构,作者基于XO44和其它EGFR的抑制剂结构,以及参考分子动力学模拟的结果,进行结构优化和改造,得到了一系列衍生物6-12。
通过TR-FRET(time-resolved fluorescence resonance energy transfer)对其进行活性测试,发现化合物11效果优于临床药物osimertinib和探针XO44,IC50为110 nM。
接着作者使用化合物11等对EGFRL858R/T790M/C797S突变体进行了时间依赖的活性抑制研究。由于共价反应需要时间,共价化合物的活性抑制往往受到反应时间影响,在此实验中,化合物11在经过3小时的预孵育后,活性提高70倍,IC50为1.5 nM。而作为对照的非共价抑制剂则不会有活性的提高。
图二:预孵育前后对EGFRL858R/T790M/C797S活性抑制实验
作者随后使用LC-HRMS确认了化合物11对Lys745共价位点,使用的是EGFR突变体中包含Lys745的一段小肽(-IPVAIK745ELR-)。
图三:LC-HRMS确认共价位点
最后作者在表达C797SEGFR突变体的Ba/F3细胞上进行了增殖抑制实验和机理探讨。相比较与osimertinib,化合物11能够明显地抑制EGFRL858R/T790M/C797S的磷酸化水平,然而并没有抑制EGFRdel19/T790M/C797S的活性。
图四:Ba/F3细胞的western和MTS实验
对EGFRL858R/T790M/C797S突变的Ba/F3细胞增殖抑制活性为500 nM,明显优于osimertinib。
——总结——
这篇文章设计合成优化了靶向EGFRL858R/T790M/C797S突变的赖氨酸共价抑制剂,大大提高了其抑制活性,对解决临床中出现的EGFR突变耐药问题做出了突出贡献。
参考文献:
Ferlenghi F, Scalvini L, Vacondio F, Castelli R, Bozza N, Marseglia G, Rivara S, Lodola A, La Monica S, Minari R, Petronini PG, Alfieri R, Tiseo M, Mor M. A sulfonyl fluoride derivative inhibits EGFRL858R/T790M/C797S by covalent modification of the catalytic lysine. Eur J Med Chem. 2021 Aug 27; 225:113786.
doi: 10.1016/j.ejmech.2021.113786. Epub ahead of print. PMID: 34464874.
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