每个国家多有他的组织结构，包括地理结构和政权结构，西游记也不例外。西游记中的地理结构是三界，即天上、地上和地府，玉皇大帝是三界的领导人。我们先说地理结构：
一、地理结构
（一）天上
天有三十三重天，哪三十三重天？书中只说了离恨天和九重天，离恨天是天上老君住的地方，玉皇大帝住在第九重天，所以这个九重天是天上的政治中心，也是整个三界的政治中心。
三十三重天中，建了七十二重宝殿，哪七十二重宝殿呢？书中说了凌霄殿、朝会殿、凌虚殿、宝光殿、天王殿、灵官殿等，玉皇大帝住在凌霄殿，凌霄殿是玉皇大帝的办公场所，也是各路神仙上朝和商量国家大事的地方，这个凌霄殿相当于紫禁城。
太上老君住在第三十三重天，是天的最高端，称为离恨天，这里是道派的权利中心，太上老君在这里炼丹修道，建造武器，传授武艺，老君造的武器，可谓是威力巨大，如芭蕉扇、金刚琢，其余的天书中没有说明，应该多是有不同级别的神仙居住的。
（二）地上
地上分为四大部洲，分别是东胜神洲，南赡部洲，西牛贺洲，北俱芦洲，孙悟空就出生在东胜神洲的傲来国，唐僧是南瞻部洲人，南瞻部洲主要是东土大唐国，如来住在西天，实际是住在西牛贺洲，这个西天是在地上的，不是在天上的，应该是在地上的西面，当然还有许多的海洋、孤岛，名义上隶属于各四大部洲。
（三）地府
地府，也称冥界，地府的领导人是地藏王菩萨，地藏王菩萨属于佛派的。下设秦广王、初江王、宋帝王、忤官王、阎罗王、平等王、泰山王、都市王、卞城王、转轮王十大冥王，地府相对比较简单，没有更多的层次机构。
二、政权结构
说完了地理结构，再说政权结构，毫无疑问，玉皇大帝处于政权的顶端，他掌管三界中一切神、仙、佛、圣和人间、幽冥之事，位高权重，从名义上来说，他是三界的最高领袖，无论道派的神仙，佛派的神仙，还是无帮无派的神仙，均归玉帝领导，也就是说，佛派的神仙、道派的神仙、四大部洲的老百姓、以及众多的妖怪多是玉帝的子民。西游记中的政权结构和传统的宗教结构是不同的，传统的宗教结构是道派以玉帝为代表，佛派以如来为代表，是两个平行的宗教派别，在西游记中，佛派是归玉帝领导的，如来降服了孙悟空，玉帝设宴答谢如来，原文：如来不敢违悖，即合掌谢道：“老僧承大天尊宣命来此，有何法力？还是天尊与众神洪福，敢劳致谢？”玉帝是宣命，那么如来就是听命，玉帝是如来的上级。
在西游记中，太上老君和如来多是玉帝的下属，这个和我们平时说的情况不一样，传统的说法道教和佛教是两个教派，玉皇大帝是属于道教的神仙，和如来的佛教完全是两个体系，所以呢，我们一定要清楚一个事情，我们在这里讲的是西游记中的道教和佛教，我们讲的是西游记中的玉帝、老君和如来，和我们历史教科书上的不一样，我们在这里的西游大解密，也是针对西游记而言，前面已经说过，我们再重复一下。
玉帝以下的神仙是怎么排名的呢？我们来看一下安天大会上请了那些神仙，这些神仙的位置是怎么排的？
西游记第7回，如来把孙悟空压在五行山下，玉帝欲召开安天大会，答谢如来，书中说，玉帝传旨，即着云部众神，分头请三清、四御、五老、六司、七元、八极、九曜、十都、千真万圣，来此赴会，同谢佛恩。又命四大天师、九天仙女，大开玉京金阙、太玄宝宫、洞阳玉馆，请如来高坐七宝灵台。调设各班座位，安排龙肝凤髓，玉液蟠桃。
我们看到了，是三清、四御、五老、六司、七元、八极、九曜、十都、千真万圣，我们看一下，这多是些什么人。
三清：元始天尊、灵宝天真、道德天尊（太上老君）；
四御：紫微北极大帝、南极长生大帝、勾陈上宫天皇大帝、承天效法后土皇帝地祇；
五老：也称五方五老，分别是：
1. 西天佛老、菩萨、圣僧、罗汉，
六司：也称为南都六司，分别是：
南斗第一天府司命上将镇国真君
南斗第二天相司禄上相镇岳真君，
南斗第三天梁延寿保命真君，
南斗第四天同益筭保生真君
南斗第五天枢度厄文昌鍊魂真君
南斗第六天机上生监薄大理真君。
七元：也称北斗七星，七元解厄星君，居北斗七宫，即：
天枢宫贪狼星君，
天璇宫巨门星君，
天玑宫禄存星君，
天权宫文曲星君，
玉衡宫廉贞星君，
开阳宫武曲星君，
摇光宫破军星君。
十都：是十殿阎君
第 一 殿 秦 广王 蒋，
第 二 殿 楚 江 王 历，
第 三殿 宋 帝 王 余
第 四 殿 五 官 王 吕 ，
第 五 殿 阎 罗 王 包 ，
第 六 殿 卞 城 王 毕 ，
第 七 殿 泰 山 王 董 ，
第八 殿 都 市 王 黄 ，
第 九 殿 平 等 王 陆 ，
第十 殿 转 轮 王 薛 。
千真万圣指哪些神仙，书中没有说，比如东南西北四海龙王，天庭的四大天王多闻、广目、持国、增长天王多属于此类（以前以为四大天王是了不得的人物，其实在天庭不过是守门的门神，相当于公司的保安队长，而且法力也是有限的，在和孙悟空的打斗中，就败下阵来，所以在天上只能排在其他的人员里面）。
老君排在第一个档次--三清，而且他又是道祖，地位崇高，在天上的威望极高，西游记记第5回，所以老君来到玉帝的凌霄宝殿，玉帝和王母娘娘是跑出来迎接的。
而如来，在安天大会的以前，还处于第三档--五老级别，虽然是排在五老的第一位，但是比老君整整差了两个级别。
在西游记中，除了政权结构,还有宗教结构，也就是除了皇权还有神权，玉皇大帝是政府的领导，但是他不是宗教或者说神权的领导，在开天辟地的时候，宗教只有道教，道教的领导是太上老君，神仙们大多是太上老君的学生，天庭的官员大多是来源于道教，道教产生的时候，佛教也产生了，如来在灵山顶上修得丈六金身，对老君领导的道教产生了巨大的威胁，于是一场争执在函关发生，老君凭着金刚琢力压群佛，化胡为佛，让佛教尊道教为母教，同时老君把弥勒佛带进了佛教，让弥勒佛做了佛教的领导人，所以这个时候，虽说佛教产生了，但是从属于道教，严格意义上来说，仍然只有一个宗教，也就是道教，但是佛教的大部分菩萨、罗汉仍然忠于如来，使得弥勒佛无法真正的成为佛教的领导人，他的工作也就无法开展。
政府中的日常工作由玉皇大帝来主持了，文官以太白金星为首，武官以李天王为首，太白金星俨然是个丞相的身份，李天王是个带兵的太尉，而太上老君呢，由于他在政府里没有担任要职，虽然贵为道祖，但是天庭中多有的事情多无法直接插手，在整部西游记中，没有一件事情是出于道祖的手谕或者说道旨，反倒是如来的佛祖做得有声有色，佛旨满天飞。
我们来分析一下三个重量级人物的处境和心态：
1、
玉皇大帝看起来做得有滋有味，但他无时无刻感受到来自道祖的压力，因为天庭道派一派独大，几乎所有的天庭神仙多是道祖的学生，如果有一天，道祖振臂一呼，玉帝这个皇位马上就会不稳，在西游记第5回，道祖来到玉帝的凌霄殿，书中说，又有四个大天师来奏上：“太上道祖来了。”玉帝即同王母出迎。玉帝和他的老婆皇母娘娘是跑出来迎接的，可见老君就像太上皇一样。所以呢，玉帝是时刻提放着太上老君的，道派势力一派独大，是玉帝的一块心病。
2、
在安天大会以前，如来并不是佛祖，是什么称呼呢，我们来看书中，第7回，由于孙悟空大闹天空，无仙降妖，玉帝遂传旨着游弈灵官同翊圣真君上西方请佛老降伏。在这里，我们看到了如来的称呼是“佛老”，意思是说西方佛国的元老，如来是不满意自己现在的职务的，虽然说众多的菩萨罗汉忠于自己，毕竟名不正言不顺，所以，做上佛派的领导人，光大佛派，让佛教独立于道教，一直以来是如来的使命。
3、
老君是道祖，道派的领导人，宗教地位崇高，但是面对善于玩弄权术的玉帝，老君的权利被架空了，因为他在天庭没有行政职务，无法直接发号施令，天庭要来哪些人才，要处罚哪些神仙，他多无权过问，他对玉帝是越来越不满意，总想凑机会敲打一下这个玉皇大帝。
整个三界就是这样的组织机构和地理结构，因为力量不平衡，各方的利益不平衡，所以一场平衡势力的斗争就此展开。
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