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Gephi是一款可以进行可视化和分析大型网络图的开源软件，可用作探索性数据分析，链接分析，社交网络分析，生物网络分析等，功能非常强大，支持Windows， Mac OS X等多个平台。有需要的用户可以下载试试哦。
软件地址【 chengdongds.top 】
功能特点
1、【实时可视化】
从最快的图形可视化引擎中获益，以加速大图中的理解和模式发现。在其特殊的OpenGL引擎的支持下，Gephi正在推动交互式高效网络探索的发展方向。
网络最多100，000个节点和1，000，000个边缘
使用动态过滤迭代可视化
丰富的图形处理工具
2、【布局】
布局算法为图形赋予形状。Gephi提供最先进的算法布局算法，以提高效率和质量。布局调色板允许用户在运行时更改布局设置，从而显着增加用户反馈和体验。
基于力的算法
优化图形可读性
3、【度量】
统计和度量框架为社交网络分析（SNA）和无标度网络提供了最常用的指标。
中介中心性，贴近度，直径，聚类系数，PageRank
社区检测（模块化）
随机发生器
最短路径
4、【创建制图】
使用排名或分区数据使网络表示有意义。自定义颜色，大小或标签，以便为网络表示带来意义。矢量预览模块允许您在使用SVG或PDF进行探索之前进行最后的触摸和关注美学。
可定制的PDF，SVG和PNG导出
保存预设
5、【动态过滤】
过滤网络以根据网络结构或数据选择节点和/或边缘。使用交互式用户界面实时过滤网络。
无需脚本即可创建复杂的筛选查询
根据过滤结果构建新网络
保存您最喜欢的查询
1、Gephi 是一款网络分析领域的数据可视化处理软件，其目标是成为 “数据可视化领域的 Photoshop”。
2、Gephi是一款开源的交互式的复杂网络分析平台。
3、它支持Windows, Mac OS X以及Linux等环境。主要功能包括：
4、Gephi被用于互联网，生物医学，交通网络分析等各个领域。
5、Gephi 是一款开源免费跨平台基于JVM的复杂网络分析软件, 其主要用于各种网络和复杂系统，动态和分层图的交互可视化与探测开源工具。
6、可用作：探索性数据分析，链接分析，社交网络分析，生物网络分析等。
7、Gephi 是一款信息数据可视化利器。
8、Gephi 可以供大学研究项目数据分析使用，新闻工作者，统计研究，微博信息研究等。
9、Gephi 是进行社交图谱数据可视化分析的工具，不但能处理大规模数据集并生成漂亮的可视化图形，还能对数据进行清洗和分类。
10、Gephi是一种非常特殊的软件，也非常复杂，先于他人掌握Gephi将使你一骑绝尘。
数据处理
以CSV格式文件为例：
边文件（(edge)：前两列为节点ID，另一列为相关系数。
节点文件(node)：一列节点ID，一列节点类型
导入数据
当然你要打开Gephi。【文件】→【打开】选择文件，在点击下一步的同时注意一下每个参数的含义是不是你要表达的意思。分别导入节点文件与边文件。
输入第二个文件时 注意：
设置布局样式
Gephi提供多种布局方式，一般圆形网络图选择”Fruchterman Reingold”布局格式。点击【运行】，等布局稳定后，点击 【停止】，生成圆形布局的网络图。
网络拓扑参数计算
点击【窗口-统计】面板，分别点击 【运行】-【关闭】当然你也可以选择打印、复制，保存，最终你还是要选择关闭。进行以下6个拓扑参数的计算:平均度、网络直径、图密度、模块化、平均聚类系数、平均路径长度。
注：对于无向网络图，平均度和平均加权度 数值相同。再次注意：可能会卡。
节点设定
点击【窗口】-【外观】-【节点】-大小-数值设定，选择渲染方式为 度，设置节点大小的 最大尺寸和最小尺寸（此处分别为20和70），点击 应用。颜色设置也在外观节点中，设置渲染方式为Modularity Class注意红色方框里内容，从左到右依次为：颜色、大小，标签颜色、标签尺寸。
边设定
在【外观】中选择【边】Partition 渲染方式选择pn即我们数据中相关性标签；Ranking选择【度】。如下：
预览修饰
点击预览，修改如下图红色方框选项，在 预览设置 面板对网络图进行输出前的最后修饰。
边框宽度：设为0.0，不显示节点边框。
显示标签：打勾，显示节点标签。
字体：此处修改为 Times New Roman 23号 加粗
缩短标签：打勾，不然标签会过长导致相互覆盖。
厚度：根据显示需要修改边线厚度，此处改为5。
重新调整权重：打勾，根据边线权重显示不同厚度。
另外的选项可根据需要自行调整。在之前的设置中也可以通过预览来查看效果，一步一步调整。
图像导出
Gephi 支持多种格式的输出：SVG、PNG、PDF、gexf图文件等。
节点：相同颜色是同一个门；节点大小表示连接度；
边：红色正相关，蓝色负相关（spearman），粗细表示相关系数绝对值大小；
导出的矢量图可用AI等图形编辑软件进一步修改，图形文件也可以用脚本来处理，图个性化地添加图例等。图文件也是一种标签语言。
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