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文献解读 | 生信文章学会这个套路,轻松搞定6+ 通路相关干湿结合研究

大家好,今天小编再给大家分享一篇6+ 通路相关干湿结合的文章题目是α-Ac tinin 1 promo tes tumori genesis and epith elial-mesen chymal tran sition of gastric cancer via the AKT/GSK 3β/β-Cate nin path way(α-肌动蛋白1通过AKT/GSK3β/β-连环蛋白途径促进癌症的肿瘤发生和上皮-间质转化)从投稿到接收仅三个月,快一起来看看吧~

01

研究背景

α-肌动蛋白1(ACTN1)是一种肌动蛋白交联蛋白,与细胞分裂、细胞粘附和细胞迁移有关。此外,它还参与某些癌症(如乳腺癌)的肿瘤发生和发展。

我们探讨了ACTN1在胃癌(GC)中的功能,但目前尚不清楚。来自基因表达综合(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA)的高通量测序和公共微阵列数据集揭示了ACTN1在预后不良的胃癌中的上调。

这些结果通过蛋白质印迹(WB)、实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR)和免疫组织化学进一步验证。构建了功能胃癌细胞的丧失和增加,揭示了ACTN1过表达对促进GC细胞增殖、侵袭、迁移和抑制细胞凋亡的作用。

机理研究表明,ACTN1通过AKT/GSK3β/β-连环蛋白途径调节胃癌的上皮-间充质转化(EMT)和肿瘤发生,AKT MK2206抑制剂证实了这一点。总之,这些结果表明ACTN1可能是胃癌治疗的有希望的候选药物。

见图一

ACTN1在GC中的异常表达。

图一

a 从 10 对 GC 肿瘤(肿瘤)和邻近正常肿瘤(正常)获得高通量测序结果。

b 根据GEPIA(P < 1.408 *),从TCGA数据库和GTEx获得的211个GC样本和0个非癌样品之间的ACTN05异常表达。

c 多个基因符号:
(208636_at;208637_x_at;211160_x_at)表明,根据Kaplan-Meier绘图仪对数秩(P < 1.0ACTN001)与不良的总生存期有关。

d GSE79973 (肿瘤 n(t) = 10;正常 n(n) = 10), GSE118916 (肿瘤 n(t) = 15;正常 n(n) = 15), GSE54129 (肿瘤 n(t) = 111; 正常 n(n) = 21), GSE56807 (肿瘤 n(t) = 5; 正常 n(n) = 5), GSE26942 (肿瘤 n(t) = 205; 正常 n(n) = 12)) 显示 ACTN1 在胃癌 (GC) 肿瘤中显着上调(P < 0.05 被视为统计学意义。

见图二

ACTN1在GC组织和细胞系水平上的异常表达。

图二

a  蛋白质印迹显示,相对于相邻的正常肿瘤(正常),1对GC肿瘤样本(肿瘤)中有8对的ACTN10上调。

b  通过RT-qPCR测定1对胃癌(GC)肿瘤(肿瘤)和邻近正常肿瘤(正常)之间ACTN19的mRNA水平。

c ACTN1的代表性免疫组织化学(放大倍数:200×; 400×;比例尺 20um)。

d-和 e.人胃上皮细胞系 (GES-1) 和 GC 细胞(HGC-1、AGS、MKN-27 和 MKN-45)之间 ACTN28 的蛋白质 (d) 和 mRNA (e) 水平 (P < 0.05 *, <0.01 **, <0.001 ***, <0.0001 ****;GAPDH作为RT-qPCR和WB的上样对照)。

见图三

ACTN1促进GC的增殖。

图三

a 通过 RT-qPCR 在 GC 细胞(空质粒作为阴性对照 [VEC])中确认了 ACTN1 过表达质粒 [OE] 的转染效率。b RT-qPCR和WB分析表明,siRNA3的敲低效率最高(siR-NC为阴性对照[NC])。

c siRNA3和ACTN1过表达质粒用于随后的敲低和过表达实验(siRNA3 [SH],siR-NC [NC],ACTN1过表达质粒[OE],对照质粒[VEC])。

d 通过EDU掺入检测的胃癌的增殖能力。使用GraphPad量化EDU阳性率的直方图,结果表明ACTN1的过表达促进了增殖,而其敲低则逆转了这种效应(放大倍数:100×;比例尺20um;P < 0.05 *, <0.01 **, <0.001 ***, <0.0001)。

见图四

ACTN1促进GC的侵袭,迁移并抑制细胞凋亡

图四

a  AGS和MKN-1细胞中ACTN28敲低或过表达后的细胞凋亡分析结果。

b 敲低和过表达ACTN1在胃癌(GC)中的侵袭和迁移能力(放大倍数:100×;比例尺 20um)。

c 伤口愈合试验显示,过表达ACTN1促进胃癌(GC)的迁移,而其敲低抑制GC的迁移(放大倍数:40×;比例尺 20um) (P < 0.05 *, <0.01 **, <0.001 ***, <0.0001)。

见图五

ACTN1调节胃癌中的EMT。

图五

a  通过生物信息学网站(RNA Interactomes ENCORI百科全书)进行的相关性分析表明,ACTN1与间充质标志物(CDH2,VIM,SNAI1,SNAI2,ZEB1,TWIST1,TWIST2)呈负相关,与上皮标志物(CDH1)呈负相关(P < 0.0001)。

b  E-钙粘蛋白(上皮标志物)和维门汀(间充质标志物)的免疫共荧光显示,ACTN1上调明显上调维门汀,而下调E-钙粘蛋白(维门汀染成绿色;E-钙粘蛋白染成红色;细胞核染成蓝色[DAPI])。

c  WB沉默和过表达组之间的EMT相关分子(上皮标志物E-钙粘蛋白;间充质标志物Vimentin和EMT相关转录因子蜗牛)的蛋白质水平(P < 1.0 *, <05.0 **, <01.0 ***, <001.0 ****;比例尺:0001 μm)。

见图六

ACTN1促进β-连环蛋白的稳定性和核易位。

图六

a ENCORI表明ACTN1与β-连环蛋白(CTNNB1)及其下游靶基因(CD44,FN1,C-JUN,L1CAM,MMP14)呈正相关(P < 0.001)。

b 蛋白质印迹显示,ACTN1 过表达增加了总β-连环蛋白 (t-β-连环蛋白)、核β-连环蛋白 (n-β-连环蛋白)和细胞周期蛋白 D1 的蛋白水平,而抑制了 p-β-连环蛋白(在 T41 和 S45 处磷酸化)的蛋白水平。ACTN1的敲低产生了相反的效果(LaminB1作为核蛋白的加载对照)。

c 通过RT-qPCR评估ACTN1沉默组和过表达组之间细胞周期蛋白D1(CCND1)和β连环蛋白(CTNNB1)的转录水平(P < 0.05 *, <0.01 **, <0.001 ***, <0.0001 ****)。

d 免疫荧光显示,ACTN1过表达显著上调细胞质β连环蛋白水平,同时细胞核中β连环蛋白适度升高,红色箭头表示。ACTN1的敲低产生了相反的效果(比例尺:20μm)。

见图七

ACTN1通过AKT/GSK3β/β-连环蛋白途径促进胃癌的肿瘤发生和发展,并促进EMT。

图七

a ACTN1的过表达显著促进了AKT(Ser473)和GSK3β(Ser9)的磷酸化,而其敲低抑制了这种磷酸化。

b AKT抑制剂MK2206(10 mM)显着挽救了胃癌(GC)细胞中过表达的ACTN1的迁移促进作用(二甲基亚砜[DMSO]作为对照;比例尺:20 μm)。

c 蛋白质印迹显示,ACTN1上调增强p-AKT、p-GSK3β、β-连环蛋白和蜗牛表达,抑制β-连环蛋白磷酸化。AKT抑制剂MK2206(10mM)部分挽救了ACTN1的作用。

02

研究结论

综上所述,ACTN1通过AKT/GSK3β/β-连环蛋白途径参与GC的肿瘤发生和EMT,与预后不良相关,可能是GC治疗的有希望的候选者。

好了,今天的文献解读就到这儿来,我们下期再见!

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