大家好,今天给大家介绍的文章题目为“Progno stic Signature Develo pment on the Basis of Macro phage Phagoc ytosis-Medi ated Oxidative Phospho rylation in Bladder Cancer”(基于巨噬细胞吞噬介导的膀胱癌症氧化磷酸化的预后特征发展)。巨噬细胞与膀胱癌的发生、发展密切相关。然而,很少有研究关注巨噬细胞吞噬介导的氧化磷酸化(MPOP)与BCa总体存活率的预测相关性。
01
研究背景
巨噬细胞与膀胱癌(BCa)的发生和进展相关。然而,很少有研究关注巨噬细胞吞噬作用介导的氧化磷酸化(MPOP)与BCa总生存期的预测相关性。本文旨在提出基于MPOP的靶向巨噬细胞控制作为BCa免疫疗法的治疗方法。
膀胱癌的mRNA表达数据集和临床数据源自基因表达综合(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA)数据集。对几个GEO数据集的系统研究发现,BCa和正常组织之间存在差异表达的巨噬细胞吞噬调节因子(DE-MPR)。
为了发现总体生存相关的DE-MPR并开发预后基因标记,并根据受试者操作曲线和Kaplan-Meier曲线验证性能,研究人员使用了单变量和Lasso Cox回归分析(ROC)。外部验证是通过GSE13057和GSE69795完成的。为明确其分子机制和免疫相关性,采用GO/KEGG富集分析和肿瘤免疫分析。
为了找到独立的膀胱癌预后变量,研究人员采用了多变量Cox回归分析。最后,使用TCGA数据集构建了预测列线图。结果。在BCa中,发现由PTPN6,IKZF3,HDLBP和EMC1组成的氧化磷酸化的四基因特征可以预测总生存期。
利用MPOP功能,ROC曲线显示TCGA数据集和外部验证数据集在预测总生存期方面优于传统的AJCC阶段。四基因标记可以从正常组织中识别癌症,并将患者分为具有不同总生存率的高风险和低风险组。四个MPOP基因标记是BCa的独立预测因子。
见图一
图一
该流程图说明了本研究在膀胱癌中建立巨噬细胞吞噬调节因子(MPOP)特征和预后列线图的过程。
见图二
MPOP调节巨噬细胞的吞噬作用。
图二
(a)–(f)证明组间巨噬细胞吞噬调节因子表达的差异,包括AXL (a),BASBP1(b),GNAV2(c),HIC1(d),LRRC15(e)和RNF122(f)。
见图三
巨噬细胞吞噬调节因子的功能分析。
图三
(a-c)巨噬细胞吞噬调节因子BP、CC和MF的富集分析和(d)KEGG途径的富集分析。
见图四
预后相关巨噬细胞吞噬调节因子的鉴定和建模。
图四
(a)PCA分析的结果证明了区分肿瘤与正常组织的功效。
(b)通过COX单变量回归分析筛选出四种吞噬调节剂,对肿瘤患者的预后具有预测价值。
(c、d)LASSO 回归分析建模。
(e)证明签名对肿瘤患者5年生存的预测价值。
(f) 证明签名在预测5年生存率方面的高价值。
(F-H)高危组和低危组按(基于)每组的 5 年生存率、评分和数量以及与分组相关的生存时间、生存事件和基因的表达水平进行演示。
(i) 证明签名在预测5年生存率方面的高价值。
(j) 用于预测膀胱癌患者 1 年、3 年和 5 年总生存期的柱状折线图。
02
研究结论
在预测总生存期时,整合遗传和临床预后变量的列线图优于 AJCC 分期。在高危组中发现了多种肿瘤学特征和侵袭相关途径,这也与免疫细胞浸润水平显着降低相关。结论。本文发现了MPOP特征基因,并开发了一种能够准确预测膀胱癌总生存期的预测列线图。上述发现有助于个性化治疗和医疗决策的发展。
好了,今天的文献解读就到这儿来,我们下期再见!如果你正在开展临床研究.需要方案设计.数据管理. 数据分析等支持.也随时可以联系我们。
联系客服