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SCI——生信分析类文章的构建过程(一)

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青竹中医考研中药讲师,中医硕士。

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笔记——眼科小知识

1.什么是生信分析

Definition

"生信分析" 是"生物信息学分析"(Bioinformatics Analysis)的简称属于统计学分析与生物基因学的交叉学科,主要关注使用计算机科学、数学和统计学方法来解析生物数据,特别是与分子生物学相关的数据。
在近年来,随着高通量测序技术(如 RNA-seq、ChIP-seq、Whole Genome Sequencing 等)的迅猛发展,生物信息学在生物医学研究、药物发现、精准医疗等方面扮演着越来越重要的角色。

注:高通量测序技术

①转录组测序技术(RNA sequencing,RNA-seq )就是用高通量测序技术进行测序分析,反映出mRNA,smallRNA,noncodingRNA等或者其中一些的表达水平,应用于单细胞基因表达/蛋白质表达/RNA结构的分析。

②染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也称结合位点分析法,是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具,通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究,研究体内蛋白质与DNA的相互作用,能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段

③全基因组重测序(whole genome sequencing,WGS)对全基因组进行测序扫描,能在全基因组范围之内解读所有常见和稀有变异信息,全面检测单核苷酸多态位点(Single Nucleotide Polymorphisms, SNP)、插入缺失位点(Insertion Deletion, InDel)、结构变异(Structure Variation,SV)以及拷贝数变异(Copy Number Variation, CNV)。

2.生物信息与SCI论文构建

Connection

目前此类SCI的写作模式为生信分析结合临床验证或动物实验;
其中以“临床验证+生信分析”的模式较为多见,而且简便容易操作;
通常为某一思路或观点,比如结肠癌疾病,通过生物信息分析得出导致结肠癌最常见的几种基因,然后通过临床收集结肠癌病人组织或血液信息,进行分析验证。
例如:


END


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