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2022年10月27日华大智造官方公众号发布信息(由于时差美国时间26号就发了,注1)。
这次MGI参会是以Complete Genomics的名义参加的,主推了3个产品。
DNBSEQ-T7,咱们中国区已经熟悉的不能再熟悉的平台,美国人民终于能够在2023年1月可以下单了;
DNBSEQ-T10X4,咱们稍后主要讲它,也是2023年1月就可以下单了。
DNBSEQ-E25,咱们非常熟悉的上山下海测序仪,美国人民2023年Q2就可以下单了。
DNBSEQ-T7/E25咱们是非常熟悉了,就不多说了。
咱们来盘一盘这个DNBSEQ-T10X4。
既熟悉又陌生
DNBSEQ-T10x4其实并不是个很新的平台,老早就存在,只是大家似乎都没太关注。
在NovaSeq X上市之后我提到了这么一嘴(戳这里):
然后有股东就帮忙找出了T20,于是随后在这篇文章(戳这里)有了回应。
其首次中提到DNBSEQ-T20用的浸没式测序生化技术。
那么,从这些线索来看,位于重庆金凤实验室的DNBSEQ-T20(RS是指research版本)确实属于DNBSEQ-T10x4产品线。
从这点来看,T10x4是T20的高阶版本。
产品定位
非常明显,T10x4是在大规模基因组测序研究领域与Illumina硬刚的产品。
自从NovaSeq X上市之后,Illumina中国的宣传风就变成了这样。
也就是说,通过引导需求向更广泛物种转移,来释放NovaSeq X平台的测序潜能。
顺便挣钱。
那么华大就顺势把T10x4抬了出来。
比通量,说实话,MGI没输过。
华大智造在战略安排上还是ok的,大概能够推断出这次ASHG的排兵布阵。
首先,利用DNBSEQ-T7来挤占NovaSeq 6000的生态位,趁着NovaSeq X根基不稳,利用价格优势拿下一些典型客户;
其次,利用DNBSEQ-T10x4来填补客户MGI测序通量不如Illumina的心智空白,避免产生心理落差,顺便借着NovaSeq X的话题来一波借势营销;
第三,利用DNBSEQ-E25的独特特性,比如搬地方无需校准等,来卡Illumina空白的生态位。
有点意思哦。
性能参数
先上一张之前三个大规模测序平台的对比图
(原文表中T7的reads数少打一个0)
可以看到,在NovaSeq X面前,DNBSEQ-T7确实不够看了。
那么加上DNBSEQ-T10x4会怎样呢?
直接将FC密度推到以billion作为基础计量单位,DNBSEQ-T10x4可以同时运行8张密度为32B的FC,推测单个测序模块是2张FC,总计4个测序模块。
推测,支持MGI“祖传”的全异步上机测序模式,能够各个模块支持不同的测序模式和不同的上机时间。
那么,这个平台,无论是单FC密度、整机产出都完全碾压NovaSeq X Plus最高密度的芯片。
当然,带来的副作用就是测序时间的延长,达到了108小时。
其体积和重量也达到了“恐怖”的程度。
可以说这不是一个“仪器”,而是一个包含自动化样本提取+自动化文库制备+高通量测序+数据中心的一体机,外加一个机械臂的结局方案。
特色技术
当然,最吸引人的还是MGI应用在其上的新技术。
根据MGI公开的信息(注2),DNBSEQ-T10x4使用了全新的浸没测序生化技术。
这种技术有两个好处:
测序试剂重复利用(???!!!!),进一步压榨测序成本;
支持更大尺寸的测序FC,也就意味着测序通量的提高;
从目前的信息推测,T10x4使用的FC尺寸较大,还有很大的进步空间。
目前还没有看到浸没测序的技术细节,如果哪位朋友有相关资料,欢迎后台私信。
不过,从CN109799603A和CN207571378U两个来自长光华大的专利可以管窥一下。
这两份专利都申请于2017年,其核心是用于检测的显微物镜镜头直接浸没入测序反应池中,也就是说测序的FC是裸露的,没有盖板的。
大概率可以推测,T10x4的FC是没办法分lane的。
如果后期改进FC密度,测序时间将能够大幅度降低,届时,浸没生化技术下放到其他机型也未可知。
总结
稍微总结下DNBSEQ-T10x4。
DNBSEQ-T10x4不是一个“设备”,而是一整套产品组合的解决方案;
DNBSEQ-T10x4从测序通量上完全碾压Illumina NovaSeq X系列;
独特的浸没式测序生化技术可能带来巨大的成本优势
测序时间较长,芯片密度推测仍有很大进步空间;
总的来说,DNBSEQ-T10x4的应用场景可能会受到限制,Sema4不是在做10万人的全基因组测序嘛,我觉得可以先找他们聊聊。
就个人而言,T10x4不够优雅,没有明显RGB灯条,不够炫酷(这段删掉)。
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注1:https://www.prnewswire.com/news-releases/complete-genomics-part-of-mgi-announces-next-generation-sequencing-platforms-at-ashg-annual-meeting-301659413.html
注2:https://www.mgi-tech.com/Download/download_file/id/297
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