各位股东朋友,大家好。
咱们又如约见面了。
昨天给大家推荐的博主感觉如何?
今天周一,希望大家一切顺利哦。
废话不多说,开整。
这次咱们来个“双黄蛋”,聊聊做SV(structure variation)测序的两家公司-Bionano和Nabsys。
这两家公司几乎同时创立,也都跟咱们有着千丝万缕的关系。
之前大略说过,今天咱们就拆解下。
SV-二代测序的小短腿
二代测序(NGS)在常规变异检测上(indel,SNP)几乎不存在任何问题。
但是大的SV(structure variation)检测上(>1kb)就是小短腿了。
这经常被三代测序和纳米孔测序拿来说事。
不过他们也被今天咱们谈论的主角Bionano拿来说事(注1)。
是不是reliable咱不好说,反正Bionano是这么说的。
基于这个原因的,Bionano和Nabsys就在那个测序仪百花齐放的年代创立了。
Bionano
Bionano成立于2003年,创始人是Han Cao博士。
Cao博士,1990年本硕毕业于中科大分子生物学专业,后1998年毕业于Delaware大学。宾大做了一年博后后进入普林斯顿大学,于2003年创办Bionano。
后来Bionano经历了一系列的融资,并于2018年Bionano IPO,目前市值大约7.9亿美元。
当然现在的Bionano Cao博士早就离开了,创建了一个新公司叫Nuco,也不知道是干啥的。
现在,就这高管们一个季度720万美元的营收都不知道够不够开工资。
Nabsys
Nabsys则成立的稍晚一点,2004年成立。创始人包括布朗大学的物理学教授Xinsheng Sean Ling、Leon Cooper以及Barrett Bready。
不过目前能查到的Founder就只剩下Barrett Bready了。
但是Nabsys的路比较坎坷,2015年被媒体爆出关门大吉(其实并没有)。
而最让我们所熟知的是2016年中科紫鑫4200万美元准备收购Nabsys的事情了。
然而紫鑫最后也没有了最后。
Nabsys也只能再求生路了,根据crunchbase的数据,我们发现在2016年收购事件之后,Nabsys似乎进入了休眠期,直至2019年10月才有了F轮的融资,这次算是找到了新的金主-Hitachi(日立)。
由于Nabsys也没上市,不知道日子过得怎么样。
反正Bionano还会经常在科研领域听到过,Nabsys是真不知道了。
技术
Bionano称自己的技术叫Optical Genome Mapping(OGM),光学图谱。
其技术原理非常直接,根据其最新的DLS技术(Direct Label and Stain),通过使用DLE-1酶特异性识别CTTAAG,然后通过连接荧光标记在这个位置上,然后通过微流控纳米芯片将目标DNA分子线性化(也就是拉直),这样在后面成像的时候才不会糊成一坨。
这些标记好的DNA分子乖乖的排列在芯片的channel上,被光学系统捕获信号。
由于CTTAAG是有荧光的,channel长度也是已知的,那么就可以通过荧光信号计算出在这些tag之间的距离。
进而通过tag之间的距离比对参考序列,进行SV检测了。
Nabsys的技术方案与Bionano可以说是非常类似,只不过Nabsys更为激进一点,直接使用了半导体测序的方案。
同样的,DNA同样被标记特定位点,这些位点在基因组上广泛分布。
然后标记好的DNA样本被载入测序芯片,样本高速线性的按照一定速度通过测序芯片,芯片可以检测特定位点的电信号。
那么分子通过芯片的速度是已知的,通过特定信号产生的时间变化就可以定位这些tag的相对位置。
通过与参考基因组比对,就可以获取SV的信息了。
由于不能获得整个样本DNA的全部序列信息,之前某公司宣传的这个方法是单分子测序是不准确的。
您不能指望这玩意单独的把序列给您装出来不是,还是实事求是好点。
最后
其实这俩公司所关注的领域相对比较小众的。
这样就注定了其产品很难获得大范围的应用。
Bionano市值目前还不到8个亿,就还行吧,起码比Nabsys好。
对了,联想创投还是当年Bionano的大股东哦,你说,这两家跟我们还是关系颇深吧?
不过,要是技术进步了,突然把两家的技术成本降低到足够低,且能自动化,被临床认可。
那么,取代核型分析,成为SV检测标配。
那岂不是一桩美事?
(完)
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