一、维吾尔族的起源
比起南北朝时期才出现在我国史料中的外来的突厥，维吾尔族的历史实在久远得太多太多，最早可以追溯到春秋战国时期的赤狄，与匈奴的先人白狄是非常亲近的兄弟。秦汉时期则改称丁零，到了南北朝时期又被称作敕勒、铁勒、高车等。
不过，由于相对弱小，维吾尔族的先人们只能被不同时期的强大的草原帝国所统治。大家所熟知的鲜卑诗歌《敕勒川》，实际上就是敕勒人所创作的。到了柔然和突厥称霸草原的时候，高车族也一直是被欺负的角色。
当时的高车分成六部，其中袁纥就是维吾尔的祖先；而乌古斯则是土库曼是亲兄弟。从这个意义上讲，维吾尔与土库曼更近一些。
公元605年，也就是隋朝时期。残暴的西突厥毫无征兆地利用聚会的机会活埋了数百名高车各个部落的酋长，激化了双方本来就很深的矛盾。各个高车部落组织起了反抗突厥的部落联盟----正式叫做“回纥”。
由于有突厥这个共同的敌人，回纥和强大的唐朝以及铁勒的薛延陀部共同组成了反突厥联盟，齐心协力打败了突厥帝国。投桃报李，在唐朝的帮助下，回纥人在突厥旧地，建立了幅员辽阔的回纥汗国，并承认唐朝的宗主国地位。
二、回鹘是唐朝的好兄弟
回纥汗国的建立与唐朝的帮助密不可分，唐朝的安全也得到了回纥的大力支持。回纥不但帮助唐朝赶走了东西突厥，还在平定安史之乱的过程中起了很大的作用。
作为双方亲密关系的证明，唐朝曾经派了三位货真价实的公主，也就是皇帝的亲生女儿远嫁回纥。这在中原王朝与游牧民族的和亲史上是绝无仅有的，以往和亲派过去的顶多是宗室的女儿，甚至是王昭君这样的宫女。
同时，双方的贸易往来也很频繁，主要是回纥的马匹交换唐朝的丝绸。这个期间，回纥改名为回鹘，寓意是天空翱翔的大鸟。
但是，随着唐朝的衰落，回鹘汗国也不断的衰落下来。终于在840年，也就是唐朝消亡的60年前，由于出现了内奸，位于西边的黠嘎斯部族，也就是吉尔吉斯斯坦和我国柯尔克孜族的祖先，派了10万骑兵讲回鹘汗国这个过去的主人消灭了。
灭国后的回鹘人一部分投奔了唐朝，被赐姓李以后逐步汉化。还有一大部分被迫西迁。西迁的回鹘人有三支，一支落脚在甘肃的张掖，被称作“甘州回鹘”，几经变迁成为今天裕固族的祖先。
还有两只分别到了新疆的吐鲁番和中亚的吉尔吉斯斯坦，分别被称作“高昌回鹘”和“葱岭西回鹘”，后者还曾经建立起强大的喀喇汗帝国。这两支构成了今天新疆维吾尔族的主体。在这个过程中，由于受到西部邻居----萨珊波斯的影响，回鹘人的宗教信仰也从佛教转变成伊斯兰教。
三、维吾尔族在新疆
唐朝末年，回鹘汗国被黠嘎斯灭国之后，被迫西迁葱岭西回鹘建立了盛极一时的喀喇汗王朝，与高昌回鹘一起，开始了维吾尔族扎根新疆的征程。
也正是在这一时期，中亚和中国新疆地区操突厥语系的各个不同部族在相同语系和相同信仰的煽动蛊惑下逐步产生了后来的泛突厥主义思潮。
北宋末年，被大金和大宋联手击败的大辽残余，在契丹贵族耶律大石的带领下，到了新疆，击败了喀喇汗王朝，建立起西辽政权，回鹘人自然也成了西辽的附属。
到了蒙元时期，蒙古骑兵横扫欧亚大陆，新疆又成为了察合台汗国的领地。明朝时期，中央政府对新疆的管理处于退缩状态，当时新疆的主要政权是察合台汗国的后裔所创立的叶尔羌汗国。
到了清朝时期，叶尔羌汗国被叛乱的准噶尔汗国所灭。康熙大战噶尔丹说的就是大清平叛准噶尔的这段历史。平定了准噶尔汗国，新疆也再次回到了祖国的怀抱。
尽管1865年发生了中亚来的塔塔儿人阿古柏发动的叛乱，成立了所谓的“哲德沙尔汗国”，但在钦差大臣左宗棠的坚决打击下，清政府最终在1877年成功收复新疆，并于1884年正式设立新疆省。
进入20世纪初，随者清朝的结束，新疆东突分裂主义分子也有所抬头，但都遭到了当时的民国政府的坚决反对和迎头痛击。1949年，新疆和平解放。1955年，新疆维吾尔自治区正式成立。
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