正交与反交是针对于同一组亲本而言的，如果♀P1×♂P2是正交的话，则♀P2×♂P1则是反交。 正反交实验主要有两方面的用途：正反交实验结果是否一致可以推断控制性状的基因是细胞核基因还是细胞质基因控制的；正反交实验结果是否一致也可推断控制性状的基因是常染色体基因还是性染色体基因。————看杂交后代的比例。
（1）若正交、反交子代表现型一致且与性别无关，遵循遗传定律，则属于细胞核遗传且基因位于常染色体上。
（2）若正交、反交子代表型不一致且与性别有关，遵循遗传定律，则属于细胞核遗传且基因位于X染色体上。
（3）若正交、反交子代表现型与母体相同，无一定的分离比，不遵循遗传的三大定律，则属于细胞质遗传。（植物母本所结的果实除外，因为果皮不是子代）
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